More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0990 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 332 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  86.09 
 
 		 328 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  77.48 
 
 		 332 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  47.58 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  48.14 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  44.41 
 
 		 324 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  44.82 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.48 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.97 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.73 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  36.59 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.65 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.95 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.74 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.03 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.18 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.67 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  37.37 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  35.03 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.44 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.33 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  39.16 
 
 		 386 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.17 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.95 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.95 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.92 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.92 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.43 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.18 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.36 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  36.54 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.13 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  37.85 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.34 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  35.89 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  35.93 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  36.27 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1763  hypothetical protein  36.96 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.31 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  33.83 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  34.34 
 
 		 320 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.67 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.63 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.63 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  36.24 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.12 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  38.44 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.08 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.27 
 
 		 325 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.65 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  35.08 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  34.95 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 348 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  33.64 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  37.37 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.42 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  35.24 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.79 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.06 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  33.13 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.7 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  33.77 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  36.5 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  37.17 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  35.1 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.45 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.27 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  38.64 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  35.22 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  36.93 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  35.02 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.07 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  34.52 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  37.2 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  35.79 
 
 		 338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  34.97 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  35.47 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.63 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  33.55 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  36.79 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  37.59 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  35.62 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  34.83 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  35.14 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  37.04 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  33.9 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  33.85 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.23 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  37.04 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  33.85 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.85 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  38.7 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  38.31 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3510  hypothetical protein  37.25 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>