More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1763 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1763  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  79.19 
 
 		 324 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5750  hypothetical protein  81.29 
 
 		 325 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  49.69 
 
 		 320 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.48 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.48 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.43 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.19 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.76 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.12 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.89 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.94 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.12 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.76 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.52 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.99 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.07 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.42 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  39.94 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.02 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.75 
 
 		 335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.8 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.02 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.38 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.06 
 
 		 326 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.92 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.65 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 335 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.12 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 329 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  41.24 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.84 
 
 		 327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.58 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.99 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.69 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.84 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.93 
 
 		 304 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  41.88 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.8 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  40.72 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  39.6 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  39.6 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.32 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.63 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.06 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.22 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.19 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.75 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.53 
 
 		 328 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  41.02 
 
 		 362 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.06 
 
 		 325 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.78 
 
 		 335 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.66 
 
 		 339 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  37.42 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  40.2 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.53 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.74 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.87 
 
 		 318 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.38 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.7 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  40 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.61 
 
 		 335 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  40.12 
 
 		 330 aa  225  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.47 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.97 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.38 
 
 		 314 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  39.58 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.23 
 
 		 345 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.81 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.31 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  38.78 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.75 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.35 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.23 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.72 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.06 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  38.87 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  37.85 
 
 		 344 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  40.95 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.27 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  37.37 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  42.04 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.42 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  40.98 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.46 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.46 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.42 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  41.84 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  40.67 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  38.58 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.25 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.44 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  36.08 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>