More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5750 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5750  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  88.92 
 
 		 324 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1763  hypothetical protein  80.2 
 
 		 332 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  51.88 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.3 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  43.77 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.55 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.48 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.88 
 
 		 337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.67 
 
 		 339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.42 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.05 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.42 
 
 		 327 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.05 
 
 		 328 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.48 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.69 
 
 		 339 aa  251  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.49 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.57 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  42.9 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.93 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.05 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.87 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  242  7e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.06 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 358 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  42.61 
 
 		 325 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.44 
 
 		 344 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.85 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.67 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.26 
 
 		 326 aa  235  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.93 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.93 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.01 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  39.23 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.47 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.31 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  38.53 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.45 
 
 		 333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  39.76 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  41.82 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  39.56 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  44.33 
 
 		 330 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.24 
 
 		 339 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  39.09 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.15 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.84 
 
 		 356 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.36 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36.98 
 
 		 337 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.82 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.19 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.57 
 
 		 353 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.47 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.78 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.53 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.53 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.4 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.13 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.3 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  39.41 
 
 		 335 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.1 
 
 		 339 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.81 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.67 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  41.02 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.81 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.46 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.13 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.63 
 
 		 698 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.37 
 
 		 356 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  41.2 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  36.24 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.71 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.22 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  37.97 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40.72 
 
 		 336 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.26 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.58 
 
 		 327 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.05 
 
 		 351 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.06 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.74 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.67 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  36.69 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.68 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  40.66 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.76 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.89 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  37.77 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.08 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.01 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.76 
 
 		 331 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.8 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.66 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.07 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>