More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4497 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 322 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  85.71 
 
 		 322 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  43.45 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  43.2 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  45.3 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  44.48 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.5 
 
 		 334 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.4 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.66 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2282  hypothetical protein  37.65 
 
 		 328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.736343  hitchhiker  0.00501521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.59 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.94 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  35.49 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.82 
 
 		 325 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.14 
 
 		 337 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  34.67 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.91 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.2 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  39 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  35.8 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.28 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.48 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.33 
 
 		 348 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.48 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  35.78 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  37.42 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  35.81 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  35.96 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  36.33 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  34.86 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.42 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  37.16 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  36.02 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  39.61 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.5 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  39.66 
 
 		 334 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.15 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  39.06 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.57 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  38.24 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.85 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  36.63 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  39.25 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3854  hypothetical protein  36.79 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3165  hypothetical protein  38.26 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209597  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  35.38 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.13 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  36.65 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  37.58 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.05 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.8 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  35.31 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  35.35 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  37.15 
 
 		 332 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.67 
 
 		 323 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  35.35 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  36.39 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  37.46 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  37.33 
 
 		 332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  35.2 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.01 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.12 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  37.2 
 
 		 339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  36.86 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.29 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  37.04 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3813  hypothetical protein  40.78 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  34.88 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  38.06 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  34.94 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.22 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  39.87 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.37 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.7 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  35.69 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  35.44 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.89 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  33.65 
 
 		 325 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  35.45 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  36.36 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.49 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.05 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  35.29 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5507  hypothetical protein  35.51 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  34.59 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  32.26 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  38.01 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  36.79 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  35.65 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5819  hypothetical protein  38.76 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  36.79 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  35.8 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>