More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5819 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5819  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.69 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.31 
 
 		 323 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  41.28 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.71 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.71 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.52 
 
 		 328 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.52 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.85 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.85 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.38 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.86 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.39 
 
 		 356 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.47 
 
 		 330 aa  246  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.12 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.64 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  41.39 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  41.95 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.95 
 
 		 327 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.12 
 
 		 331 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.86 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.86 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  40.24 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.89 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.62 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.73 
 
 		 336 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.39 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.51 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.37 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.67 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 326 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.37 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  42.43 
 
 		 395 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  41.39 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.86 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  41.09 
 
 		 326 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  39.29 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.8 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  41.53 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.62 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.45 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.18 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.41 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.86 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  38.39 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.04 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 332 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  42.67 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.53 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.44 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  39.51 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.68 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  42.47 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.14 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  41.77 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  41.67 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.75 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  37.73 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.52 
 
 		 322 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  41 
 
 		 326 aa  229  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.95 
 
 		 314 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.6 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  41.89 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.76 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.67 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.75 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.55 
 
 		 324 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.75 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  40.62 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.13 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  38.17 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.96 
 
 		 351 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  40.71 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.85 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  42.95 
 
 		 335 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  41.28 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.92 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.65 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1368  hypothetical protein  37.97 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.391308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.83 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.42 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.26 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  39.4 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 335 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  41.92 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.27 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.2 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.53 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  41.92 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  39.64 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  38.87 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.17 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.16 
 
 		 333 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  40.53 
 
 		 322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>