More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1427 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 334 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  87.39 
 
 		 395 aa  577  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.05 
 
 		 331 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.99 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.43 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.12 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.56 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  38.81 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  42.33 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.55 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.25 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  42.33 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  43.65 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.01 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.97 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.14 
 
 		 328 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.14 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.61 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.52 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.39 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.28 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  41.92 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.33 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.69 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.74 
 
 		 339 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  39.93 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.57 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  43.56 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.74 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.5 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.19 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.77 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.5 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  41.08 
 
 		 341 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  43.48 
 
 		 338 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.72 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  40.61 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  37 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.37 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40.65 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  38.59 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.53 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  40.26 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  43.59 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1351  Fis family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 312 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  40.96 
 
 		 386 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  37 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  38.23 
 
 		 323 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.39 
 
 		 312 aa  232  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.61 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  40.94 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  39.1 
 
 		 352 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  41.91 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.63 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5452  hypothetical protein  39.26 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  40.52 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  39.44 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1997  hypothetical protein  43.59 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.02937  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  39.06 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.8 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.05 
 
 		 314 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  40.98 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.94 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  38.23 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.58 
 
 		 325 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.48 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  39.38 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  38.8 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  41.41 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.23 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.74 
 
 		 339 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  39.94 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.24 
 
 		 344 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  39.33 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  37.31 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.74 
 
 		 345 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.41 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.74 
 
 		 345 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  36.56 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  37.34 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  38.96 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  38.84 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.8 
 
 		 332 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  38.37 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  37.23 
 
 		 330 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.06 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  37.92 
 
 		 698 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.6 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.8 
 
 		 324 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.26 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5007  hypothetical protein  39.26 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  38.67 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.85 
 
 		 330 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.58 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.21 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>