More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4432 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  634    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  80 
 
 		 326 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0911  hypothetical protein  68.12 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  49.34 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.51 
 
 		 345 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.51 
 
 		 345 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  46.79 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  44.68 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  47.42 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  45.77 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  45.95 
 
 		 337 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  46.06 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.63 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  44.11 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.63 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  44.11 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  44.48 
 
 		 336 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.7 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  46.31 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.47 
 
 		 336 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  44.82 
 
 		 349 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.21 
 
 		 360 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.81 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.41 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.65 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.27 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  46.49 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  45.64 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.97 
 
 		 339 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.89 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.44 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  42.23 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.62 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  45.82 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.97 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.77 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.75 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  43.62 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  40.69 
 
 		 371 aa  242  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  43.62 
 
 		 323 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.64 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.62 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.95 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.95 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.26 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  44.15 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.27 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  43.81 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.47 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.26 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.41 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.33 
 
 		 323 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.71 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.98 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  40.33 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.43 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.99 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  42.02 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  45.87 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.62 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.85 
 
 		 330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  43.12 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.81 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  42.16 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  42.41 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  41.36 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.61 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  41.67 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  42.95 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  42.62 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.14 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.09 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.97 
 
 		 335 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  40.89 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.74 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.61 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  39.5 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  38.93 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  41.72 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.95 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.67 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.95 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  42.62 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.98 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.41 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.16 
 
 		 334 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.42 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.43 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  42.67 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.13 
 
 		 333 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  39.31 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  42.33 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  40.47 
 
 		 329 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  41.04 
 
 		 325 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>