More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5055 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5055  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 322 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  85.71 
 
 		 322 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2312  hypothetical protein  44.21 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1641  hypothetical protein  45.3 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4195  hypothetical protein  45.15 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  43.65 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.26 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  38.34 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.22 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.22 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.34 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  37.67 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  37 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  38 
 
 		 339 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  34.69 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.88 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2282  hypothetical protein  37.92 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.736343  hitchhiker  0.00501521 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  37.46 
 
 		 337 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.95 
 
 		 344 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  37.5 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.64 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.07 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  34 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  40.43 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2501  hypothetical protein  35.81 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.111791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.07 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  35.91 
 
 		 332 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  38.44 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  39.66 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  35.49 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.69 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  35.09 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  39.38 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.64 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  38.67 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  35.2 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.33 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  37 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  38.7 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3854  hypothetical protein  36.83 
 
 		 328 aa  199  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.56 
 
 		 330 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.13 
 
 		 326 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  36.79 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  36.88 
 
 		 322 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  37.96 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36.76 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  37.33 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  38.54 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  39.29 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  38.59 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  34.8 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.7 
 
 		 324 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.38 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  35.02 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.7 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3165  hypothetical protein  37.99 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209597  hitchhiker  0.0000237032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.35 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  39.66 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  40.91 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  40.63 
 
 		 326 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  35.74 
 
 		 338 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.03 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  37.37 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.92 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.51 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  37.58 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.96 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  36.36 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.38 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  33.96 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  36.81 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  36.83 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.61 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  36.34 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  34.92 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.05 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  36.82 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.49 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.25 
 
 		 325 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.29 
 
 		 356 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.77 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3813  hypothetical protein  40.13 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  38.41 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  36.65 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  37.62 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.63 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  35.45 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  35.28 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  37.75 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  36.21 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.18 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  36.33 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.24 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>