More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3597 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  74.69 
 
 		 327 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  75.67 
 
 		 330 aa  481  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  72.82 
 
 		 326 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  51.48 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  49.22 
 
 		 330 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  50.34 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  47.2 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  49.2 
 
 		 319 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  46.89 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  49 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  48.32 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  48.32 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  44.63 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  48.32 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  47.99 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  43.29 
 
 		 330 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.54 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  42.86 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.85 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.14 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.2 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  46.2 
 
 		 332 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.04 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.62 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.48 
 
 		 331 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.58 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.24 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  39.63 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  40.2 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  45.07 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.28 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3854  hypothetical protein  41.46 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  42.72 
 
 		 323 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  42.17 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.16 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.8 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.91 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  42.62 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.41 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  41.58 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  42.12 
 
 		 334 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  40.91 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.41 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  39.14 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  44.41 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  41.97 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  37.85 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.24 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  42.47 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.24 
 
 		 345 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.37 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.74 
 
 		 326 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  40 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.12 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.96 
 
 		 332 aa  238  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  38.15 
 
 		 330 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  42.28 
 
 		 332 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 		 322 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.53 
 
 		 332 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.6 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  41.86 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  42.41 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  38.17 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  43.61 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.12 
 
 		 339 aa  236  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.87 
 
 		 328 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  43.08 
 
 		 356 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.86 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  38.7 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.98 
 
 		 329 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  40.88 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  43.46 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.97 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.25 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.6 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  38.51 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.75 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  40.25 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  38.77 
 
 		 328 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  44.03 
 
 		 341 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.12 
 
 		 344 aa  232  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.89 
 
 		 318 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.89 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  40.26 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.8 
 
 		 333 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  42.11 
 
 		 338 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  40.68 
 
 		 332 aa  231  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.14 
 
 		 330 aa  231  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  41.61 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  39.88 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2932  hypothetical protein  40.5 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  41.59 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  40.8 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>