More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0578 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  58.02 
 
 		 319 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  56.42 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  53.09 
 
 		 324 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  44.79 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  44.17 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.26 
 
 		 338 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  43.1 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  42.23 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  39.55 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  41.4 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  40.57 
 
 		 330 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.69 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  41.55 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  41.1 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  40.37 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.61 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  39.76 
 
 		 326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  41.49 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  40.06 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  40.82 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  42.23 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.94 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.94 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.01 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.84 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  38.25 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.75 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.24 
 
 		 335 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  39.76 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.2 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  36.81 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.34 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.31 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.77 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.11 
 
 		 332 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.67 
 
 		 358 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  37 
 
 		 323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  38.08 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  35.8 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.47 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  36.27 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  36.56 
 
 		 346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.82 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.51 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.46 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  36.97 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  35.29 
 
 		 327 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  38 
 
 		 331 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  35.35 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.16 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  36.42 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1522  hypothetical protein  36 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  35.65 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  37.16 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  35.49 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.04 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  36.49 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  36.04 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  35.53 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  35.69 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2145  hypothetical protein  35.87 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.467573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  36.21 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.85 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  37.8 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.57 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  34.53 
 
 		 338 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  36.24 
 
 		 353 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  36.36 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.27 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  36 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  35.57 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.03 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.05 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  36.79 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  36.76 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.81 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  34.56 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  32.92 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.08 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  33.89 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.14 
 
 		 331 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  36.03 
 
 		 322 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  34.45 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  35.06 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  34.97 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  35.05 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  36.16 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2891  hypothetical protein  34.82 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2751  hypothetical protein  36.39 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  33.87 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  31.83 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.04 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  32.02 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  35.45 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>