More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0441 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  648    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  98.76 
 
 
322 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  79.08 
 
 
325 aa  524  1e-148  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  75.38 
 
 
324 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  68.92 
 
 
324 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  67.69 
 
 
325 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  58.64 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  56.38 
 
 
338 aa  360  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  50.34 
 
 
324 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  48.75 
 
 
327 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  49.66 
 
 
319 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  47.32 
 
 
330 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  48.41 
 
 
339 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  46.71 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  43.22 
 
 
330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  47.47 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  47.24 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  47.09 
 
 
324 aa  279  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.08 
 
 
358 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  49.15 
 
 
341 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.17 
 
 
326 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  47.19 
 
 
333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.2 
 
 
333 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.74 
 
 
330 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 
331 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.37 
 
 
335 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.62 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.45 
 
 
325 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  41.49 
 
 
327 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.3 
 
 
339 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.86 
 
 
336 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.57 
 
 
322 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.01 
 
 
328 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  44.27 
 
 
330 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.14 
 
 
325 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  43.13 
 
 
348 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  43.29 
 
 
334 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  43.6 
 
 
326 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.56 
 
 
334 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.96 
 
 
355 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.48 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  45.14 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.29 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.97 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.97 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  44.63 
 
 
337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.37 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.04 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.37 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.48 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.22 
 
 
345 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.75 
 
 
323 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.22 
 
 
345 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.94 
 
 
330 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.94 
 
 
330 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43 
 
 
328 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  44.08 
 
 
332 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.48 
 
 
360 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.45 
 
 
325 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  44.51 
 
 
337 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.21 
 
 
323 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.81 
 
 
327 aa  249  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 
328 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  44.97 
 
 
334 aa  248  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  42.95 
 
 
317 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.43 
 
 
327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.71 
 
 
325 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  42.86 
 
 
322 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  43.09 
 
 
336 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.5 
 
 
328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  42.5 
 
 
331 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.51 
 
 
336 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.23 
 
 
334 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.44 
 
 
356 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.47 
 
 
334 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  44.11 
 
 
330 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  44.63 
 
 
341 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  42.62 
 
 
317 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  40.18 
 
 
332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.41 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  43.03 
 
 
323 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.07 
 
 
324 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  41.58 
 
 
327 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.3 
 
 
335 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.62 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  40.95 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  41.72 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 
332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.62 
 
 
314 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  41.01 
 
 
324 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.35 
 
 
339 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  40.31 
 
 
326 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.14 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.27 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43.29 
 
 
325 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  41.01 
 
 
326 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.18 
 
 
333 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  44.63 
 
 
326 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  41.54 
 
 
331 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>