More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3801 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  71.47 
 
 		 339 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  79.46 
 
 		 338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  66.18 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  73.15 
 
 		 336 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  70.67 
 
 		 329 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  66.87 
 
 		 329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  64.4 
 
 		 331 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  68.01 
 
 		 331 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  56.13 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  55.08 
 
 		 332 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.23 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.19 
 
 		 339 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.9 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  43.69 
 
 		 332 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.95 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.2 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.79 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  43.45 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.85 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.82 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.69 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.86 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.45 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.75 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.95 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.86 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.88 
 
 		 332 aa  248  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.09 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.23 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.15 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.12 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.23 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.46 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.86 
 
 		 330 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.51 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.87 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.2 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.69 
 
 		 335 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.87 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40.2 
 
 		 698 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  40.79 
 
 		 346 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.94 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.94 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.59 
 
 		 326 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  38.61 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.58 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 		 314 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  39.38 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.92 
 
 		 343 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  40.2 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.17 
 
 		 324 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.29 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  40.68 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.29 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  38.8 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  38.94 
 
 		 312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.26 
 
 		 334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  41.46 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.62 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  40.81 
 
 		 336 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.25 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.91 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.18 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.67 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.67 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.53 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  41.2 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.36 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.14 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.53 
 
 		 328 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.31 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.8 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.06 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  39.51 
 
 		 322 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  39.87 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.4 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.95 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.47 
 
 		 331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.34 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.95 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.33 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  38.87 
 
 		 332 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.47 
 
 		 334 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  41.86 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.67 
 
 		 310 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  39.67 
 
 		 327 aa  235  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.61 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.07 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0226  hypothetical protein  41.33 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  42.28 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.46 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  38.27 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.14 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  39.74 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  38.27 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  41.53 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>