More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0709 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  653    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.38 
 
 
326 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.94 
 
 
328 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.53 
 
 
330 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.36 
 
 
335 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.94 
 
 
328 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.38 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.53 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.02 
 
 
339 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.97 
 
 
338 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.5 
 
 
331 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.97 
 
 
333 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.58 
 
 
321 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.4 
 
 
327 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.07 
 
 
330 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  39.93 
 
 
326 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  35.79 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  39.6 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  36.33 
 
 
325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.2 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.34 
 
 
331 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.89 
 
 
328 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.26 
 
 
337 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.48 
 
 
327 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  41.04 
 
 
330 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  44.11 
 
 
335 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.38 
 
 
332 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36.03 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  43.24 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  40.48 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  39.66 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  36.22 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  36.16 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.25 
 
 
349 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.36 
 
 
318 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  37.58 
 
 
332 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.98 
 
 
336 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.59 
 
 
325 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.14 
 
 
327 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  36.91 
 
 
362 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.51 
 
 
325 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.75 
 
 
326 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  39.77 
 
 
325 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.33 
 
 
328 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  41.04 
 
 
340 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.5 
 
 
318 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.18 
 
 
324 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  35.29 
 
 
329 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.42 
 
 
304 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 
329 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.35 
 
 
323 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  35.43 
 
 
330 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.09 
 
 
326 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.13 
 
 
330 aa  208  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.13 
 
 
330 aa  208  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.59 
 
 
328 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.72 
 
 
335 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  39 
 
 
325 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  37.25 
 
 
332 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  38.64 
 
 
327 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.27 
 
 
314 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.49 
 
 
328 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.03 
 
 
366 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.93 
 
 
332 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.27 
 
 
325 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  39.1 
 
 
327 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.11 
 
 
331 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  34.46 
 
 
326 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  37.37 
 
 
328 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  33.54 
 
 
331 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  36.92 
 
 
325 aa  205  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  35.9 
 
 
328 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  38.87 
 
 
332 aa  205  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 
327 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.38 
 
 
324 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  36.92 
 
 
339 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  41.63 
 
 
326 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  36.21 
 
 
327 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.91 
 
 
325 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.02 
 
 
328 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.57 
 
 
334 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  39.01 
 
 
327 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.53 
 
 
324 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.69 
 
 
356 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  35.81 
 
 
334 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  36.45 
 
 
327 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.03 
 
 
335 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  37.21 
 
 
322 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  36.21 
 
 
333 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.47 
 
 
330 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.83 
 
 
335 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  38.58 
 
 
325 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3515  hypothetical protein  39.6 
 
 
330 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327733  normal  0.573715 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  34.87 
 
 
334 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  42.59 
 
 
327 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.47 
 
 
322 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.23 
 
 
328 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  34.88 
 
 
345 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  34.84 
 
 
322 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  39.63 
 
 
330 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>