More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0972 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0972  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0157499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  87.54 
 
 		 317 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  69.48 
 
 		 322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3101  hypothetical protein  68.91 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  71.24 
 
 		 324 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  70.9 
 
 		 324 aa  434  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0252  hypothetical protein  68.54 
 
 		 325 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1994  hypothetical protein  67.56 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00362251  normal  0.711901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1794  hypothetical protein  67.56 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0184484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  68.23 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  67.91 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  42.33 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  42 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.28 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.25 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.33 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  41.36 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  40.12 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.88 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.26 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.27 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  39.38 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.81 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  40.06 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.63 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.06 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  38.32 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 		 329 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.25 
 
 		 336 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  40.92 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  39.14 
 
 		 326 aa  231  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  39.67 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.56 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.2 
 
 		 333 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.68 
 
 		 345 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.51 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  40.2 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  38.41 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.87 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.2 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.33 
 
 		 343 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.93 
 
 		 338 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.27 
 
 		 322 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.27 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  39.87 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.87 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.92 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  41.08 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.27 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.28 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.86 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.28 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.69 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  40.06 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.7 
 
 		 339 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  39.75 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  38.54 
 
 		 331 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.41 
 
 		 322 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.61 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  39.8 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.39 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  39.94 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.32 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.4 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.94 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.8 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  37.81 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.67 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.33 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.34 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.26 
 
 		 325 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.27 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.17 
 
 		 329 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.39 
 
 		 344 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  39.74 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.54 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.7 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.96 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.78 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.13 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.59 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  37.14 
 
 		 323 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.65 
 
 		 323 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.63 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.35 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.5 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  36.09 
 
 		 327 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.33 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  38.27 
 
 		 339 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.87 
 
 		 330 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  37.27 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  38.67 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  35.54 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  38.02 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>