More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2989 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  99.38 
 
 
323 aa  642    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1975  hypothetical protein  84.66 
 
 
328 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222715  normal  0.0272576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2191  hypothetical protein  83.11 
 
 
312 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623802  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1767  hypothetical protein  80.79 
 
 
304 aa  500  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1292  hypothetical protein  74.32 
 
 
325 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3791  hypothetical protein  73.56 
 
 
320 aa  454  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3300  hypothetical protein  72.04 
 
 
323 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205377  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  51.66 
 
 
335 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  52.32 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  48.94 
 
 
336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  51.83 
 
 
333 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  49.83 
 
 
333 aa  287  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.17 
 
 
345 aa  286  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.17 
 
 
345 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  47.84 
 
 
360 aa  278  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0519  hypothetical protein  46.75 
 
 
322 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515073  normal  0.0234005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  49.16 
 
 
323 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  46.98 
 
 
349 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  46.46 
 
 
325 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0535  hypothetical protein  47.64 
 
 
309 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.07 
 
 
331 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4192  hypothetical protein  46.13 
 
 
331 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.64 
 
 
344 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.52 
 
 
339 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  45.67 
 
 
355 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.64 
 
 
327 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  48.99 
 
 
353 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.14 
 
 
339 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  46.13 
 
 
322 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.21 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  46 
 
 
353 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  44.67 
 
 
330 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  48.66 
 
 
328 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.64 
 
 
330 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.64 
 
 
330 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  43.2 
 
 
323 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.3 
 
 
314 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.96 
 
 
330 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.96 
 
 
330 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.48 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.24 
 
 
326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  44 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.33 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.64 
 
 
325 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.58 
 
 
328 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.81 
 
 
335 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  43.96 
 
 
327 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.52 
 
 
324 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  44.67 
 
 
322 aa  250  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  41.01 
 
 
325 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.77 
 
 
328 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  46.49 
 
 
358 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.77 
 
 
328 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  44.05 
 
 
334 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  41.12 
 
 
334 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  43.96 
 
 
325 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.88 
 
 
330 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  42.94 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.3 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  45.3 
 
 
331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.99 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  44.24 
 
 
331 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40.31 
 
 
324 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  41.52 
 
 
321 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.28 
 
 
328 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.37 
 
 
331 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.37 
 
 
331 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  45.31 
 
 
331 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.99 
 
 
323 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.66 
 
 
333 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  42.95 
 
 
326 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  44.41 
 
 
320 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  43.62 
 
 
338 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.48 
 
 
339 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  40.95 
 
 
334 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  41.21 
 
 
339 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.68 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.61 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.92 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.29 
 
 
337 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.62 
 
 
330 aa  239  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.19 
 
 
318 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.52 
 
 
344 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  44.19 
 
 
334 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.33 
 
 
339 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  41.33 
 
 
330 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.18 
 
 
336 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.67 
 
 
324 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  42.25 
 
 
331 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  42.51 
 
 
327 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.38 
 
 
324 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.98 
 
 
333 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 
332 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  40.31 
 
 
321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  40.31 
 
 
321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.12 
 
 
335 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  41.75 
 
 
327 aa  235  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  41.52 
 
 
323 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.69 
 
 
322 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>