More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0599 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  653    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  49.33 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  45.3 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.95 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  46.05 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  46.82 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  46.36 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.81 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.81 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  43.08 
 
 		 331 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  48.18 
 
 		 335 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.93 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  45.82 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  44.63 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.41 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.05 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  44.72 
 
 		 320 aa  255  9e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.95 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.04 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.93 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.19 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  44.55 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  42.19 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  42.19 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  44.56 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 314 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.2 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  43.35 
 
 		 326 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  43.52 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  41.03 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.23 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  44.3 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.96 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  44.3 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  41.14 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.75 
 
 		 339 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  42.67 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.37 
 
 		 329 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.67 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.77 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  44.59 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.21 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  43.56 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.15 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  43 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.19 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.21 
 
 		 336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.99 
 
 		 326 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  40.99 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.25 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  41.64 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.88 
 
 		 360 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.07 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.27 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  43.22 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.47 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.51 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.07 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  41.91 
 
 		 325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.81 
 
 		 353 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.69 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  44.18 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  41.72 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.01 
 
 		 358 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.16 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  41.58 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.27 
 
 		 330 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.65 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  41.19 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.31 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  43.84 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.13 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.27 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  40.12 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42.95 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  40.12 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.78 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  39.33 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.39 
 
 		 325 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.39 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.79 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.9 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.37 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  40.42 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  42.02 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  42.66 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.36 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.18 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.88 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  39.61 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.99 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  40.8 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  41.67 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>