More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0216 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  48.7 
 
 		 349 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  49.07 
 
 		 375 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  47.2 
 
 		 368 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  47.37 
 
 		 431 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  46.26 
 
 		 362 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  42.41 
 
 		 426 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  89.39 
 
 		 160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  71.28 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  44.22 
 
 		 344 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  45.58 
 
 		 362 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  42.76 
 
 		 387 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  98.18 
 
 		 108 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  96.55 
 
 		 100 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  94.92 
 
 		 766 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  84.85 
 
 		 101 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  96.49 
 
 		 1083 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  41.4 
 
 		 400 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  85.07 
 
 		 2200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  94.74 
 
 		 93 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  96.43 
 
 		 814 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  54.05 
 
 		 382 aa  108  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  43.92 
 
 		 355 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  98.15 
 
 		 387 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  98.15 
 
 		 114 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  94.74 
 
 		 952 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  96.36 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  90.16 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  96.3 
 
 		 95 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  85.07 
 
 		 178 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  98.18 
 
 		 137 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  98.15 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  98.15 
 
 		 75 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  64.04 
 
 		 373 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  87.1 
 
 		 382 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  43.15 
 
 		 351 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  85.48 
 
 		 383 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  96.3 
 
 		 634 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  98.15 
 
 		 108 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  98.15 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  96.3 
 
 		 721 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  50.68 
 
 		 355 aa  104  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  94.44 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  96.3 
 
 		 311 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  98.11 
 
 		 383 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  98.11 
 
 		 439 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  96.3 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  91.53 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  94.44 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  43.06 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  85.71 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  96.3 
 
 		 94 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  89.66 
 
 		 106 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  89.66 
 
 		 940 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  42.11 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  94.44 
 
 		 80 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  92.45 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  94.34 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  90.74 
 
 		 113 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  42.25 
 
 		 385 aa  98.2  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  44.08 
 
 		 355 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  41.35 
 
 		 348 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  89.09 
 
 		 93 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  80.65 
 
 		 82 aa  95.9  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0118  hypothetical protein  73.91 
 
 		 120 aa  95.1  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.899916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  39.74 
 
 		 414 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  84.48 
 
 		 107 aa  91.3  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  43.8 
 
 		 381 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  42.41 
 
 		 372 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  41.3 
 
 		 374 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  40.29 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  38.51 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  35.75 
 
 		 449 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  40.88 
 
 		 368 aa  79  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  38.73 
 
 		 363 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  72.13 
 
 		 833 aa  78.6  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  38.41 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  37.78 
 
 		 344 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  38.41 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  38.41 
 
 		 363 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  43.86 
 
 		 383 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  38.41 
 
 		 363 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  38.41 
 
 		 363 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  34.33 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  35.71 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  37.9 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  39.2 
 
 		 392 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  35.84 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  36.73 
 
 		 367 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  39.2 
 
 		 363 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  39.2 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  39.2 
 
 		 363 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  42.37 
 
 		 373 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  39.33 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  37.8 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  37.61 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  36.72 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>