More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2212 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  771    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  64.13 
 
 
335 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  38.3 
 
 
328 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  37.87 
 
 
327 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  40.24 
 
 
326 aa  252  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  38.78 
 
 
315 aa  250  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  39.39 
 
 
324 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  36.29 
 
 
327 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0005  hypothetical protein  36.41 
 
 
323 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.736537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0023  hypothetical protein  36.41 
 
 
323 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.908143  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  35.96 
 
 
327 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  41.11 
 
 
383 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  41.67 
 
 
387 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  34.13 
 
 
333 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  32.61 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3035  hypothetical protein  37.32 
 
 
338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  34.86 
 
 
331 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  33.15 
 
 
331 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  33.15 
 
 
332 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  32.85 
 
 
377 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  47.67 
 
 
325 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  30.43 
 
 
336 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  31.61 
 
 
331 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5765  hypothetical protein  32.19 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  39.73 
 
 
324 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  33.71 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  29.12 
 
 
322 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4419  hypothetical protein  30.79 
 
 
321 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  30.48 
 
 
328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  30.03 
 
 
350 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1221  hypothetical protein  31.66 
 
 
315 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  30.08 
 
 
324 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  27.54 
 
 
339 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  29.48 
 
 
323 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  32.7 
 
 
332 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  29.22 
 
 
328 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  29.43 
 
 
330 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.61 
 
 
318 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.12 
 
 
328 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  31.25 
 
 
329 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  28.45 
 
 
322 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  27.22 
 
 
326 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.64 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.48 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.12 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  28.53 
 
 
332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  35.44 
 
 
321 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  30.82 
 
 
341 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  32.21 
 
 
333 aa  146  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
324 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  26.88 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  26.88 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  31.59 
 
 
331 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  31.53 
 
 
327 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  29 
 
 
327 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  41.33 
 
 
340 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  29.38 
 
 
338 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  29.16 
 
 
320 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  30.32 
 
 
328 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.67 
 
 
328 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  31.12 
 
 
318 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  35.4 
 
 
322 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  29.62 
 
 
324 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  30.89 
 
 
320 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  29.44 
 
 
327 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  29.94 
 
 
322 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  29.08 
 
 
328 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.59 
 
 
326 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0421  hypothetical protein  41.21 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  30.77 
 
 
331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.62 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  37.56 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  28.66 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  32.17 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  32.27 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  30.55 
 
 
332 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  28.77 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  28.41 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  30.92 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  38.33 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  39.06 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  38.78 
 
 
330 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  30.7 
 
 
331 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  34.38 
 
 
328 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  27.17 
 
 
322 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  39.11 
 
 
325 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4275  hypothetical protein  39.09 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0914627  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  32.34 
 
 
330 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  28.12 
 
 
324 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 
328 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  28.04 
 
 
324 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  29.29 
 
 
338 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  34.96 
 
 
327 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2769  hypothetical protein  30.28 
 
 
322 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  40.11 
 
 
318 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  30.73 
 
 
330 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  28.37 
 
 
332 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  30.25 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>