More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0830 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  773    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  43.35 
 
 
329 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4626  hypothetical protein  39.68 
 
 
318 aa  268  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  41.27 
 
 
387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.48 
 
 
330 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  37.47 
 
 
330 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  40.33 
 
 
322 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  40.97 
 
 
383 aa  239  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.61 
 
 
331 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.08 
 
 
328 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.08 
 
 
328 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  36.32 
 
 
327 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.32 
 
 
328 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  37.32 
 
 
325 aa  232  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  37.32 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.42 
 
 
314 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  34.97 
 
 
334 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.96 
 
 
334 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  35.8 
 
 
334 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.57 
 
 
330 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  34.92 
 
 
336 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.21 
 
 
330 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  38.07 
 
 
328 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  39.17 
 
 
324 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.34 
 
 
328 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.26 
 
 
328 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.36 
 
 
330 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.77 
 
 
331 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.07 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.18 
 
 
322 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.68 
 
 
327 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.98 
 
 
324 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  34.97 
 
 
336 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  34.84 
 
 
332 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  36.16 
 
 
321 aa  222  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.9 
 
 
339 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.84 
 
 
324 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  34.74 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.34 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.71 
 
 
336 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  36.1 
 
 
326 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  34.56 
 
 
339 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  36.26 
 
 
328 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  36.41 
 
 
322 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.14 
 
 
335 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  35.59 
 
 
336 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.67 
 
 
328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  34.77 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  37.26 
 
 
334 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  33.96 
 
 
328 aa  216  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.39 
 
 
338 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.7 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.49 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  33.68 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.68 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  35.33 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2774  hypothetical protein  34.56 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.56 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.05 
 
 
332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  34.37 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  35.75 
 
 
326 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  35.61 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  34.47 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  35.61 
 
 
327 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  33.81 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  35.71 
 
 
339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  38.4 
 
 
328 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  35.81 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.18 
 
 
335 aa  212  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  36.29 
 
 
318 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  33.06 
 
 
343 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  35.8 
 
 
324 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.36 
 
 
327 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4002  hypothetical protein  37.04 
 
 
335 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  34.32 
 
 
325 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  34.65 
 
 
323 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  34.99 
 
 
331 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  34.44 
 
 
343 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  34.65 
 
 
395 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.85 
 
 
333 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  33.33 
 
 
330 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  38.61 
 
 
318 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  33.69 
 
 
330 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.94 
 
 
321 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  37.5 
 
 
335 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  36.54 
 
 
323 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  34.34 
 
 
345 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.44 
 
 
332 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  34.34 
 
 
345 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.67 
 
 
325 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.51 
 
 
324 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  35.51 
 
 
321 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  34.17 
 
 
304 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  35.29 
 
 
310 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  36.81 
 
 
339 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  35.23 
 
 
317 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  37.39 
 
 
325 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0181  hypothetical protein  37.47 
 
 
341 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  34.23 
 
 
338 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>