95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0647 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  100 
 
 
940 aa  1840    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2640  hypothetical protein  58.54 
 
 
883 aa  703    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0600209  normal  0.0102086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2356  exonuclease-like protein  57.13 
 
 
856 aa  758    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1502  exonuclease-like protein  57.68 
 
 
856 aa  753    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  50.78 
 
 
846 aa  619  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  50.34 
 
 
864 aa  598  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  48.39 
 
 
856 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  48.66 
 
 
855 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  39.36 
 
 
915 aa  317  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  33.52 
 
 
947 aa  177  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  33.27 
 
 
962 aa  177  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  32.55 
 
 
951 aa  160  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  30.55 
 
 
976 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.33 
 
 
957 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  58.55 
 
 
256 aa  149  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  29.31 
 
 
991 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  28.28 
 
 
994 aa  140  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.21 
 
 
836 aa  140  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  90.48 
 
 
1083 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  69.07 
 
 
137 aa  114  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  91.67 
 
 
766 aa  113  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  82.61 
 
 
814 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  89.06 
 
 
311 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  96.43 
 
 
387 aa  111  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  94.83 
 
 
281 aa  111  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  87.1 
 
 
721 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  69.77 
 
 
952 aa  107  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  74.07 
 
 
270 aa  107  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  96.36 
 
 
439 aa  107  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  88.52 
 
 
167 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  94.55 
 
 
383 aa  106  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  81.54 
 
 
160 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  96.36 
 
 
108 aa  106  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  92.86 
 
 
109 aa  105  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.6 
 
 
312 aa  105  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  92.98 
 
 
2200 aa  104  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  67.05 
 
 
202 aa  104  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  76.71 
 
 
100 aa  104  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  89.66 
 
 
297 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  92.98 
 
 
100 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  92.73 
 
 
101 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  94.44 
 
 
220 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  88.33 
 
 
178 aa  101  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  83.87 
 
 
634 aa  101  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  92.59 
 
 
93 aa  101  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  94.44 
 
 
94 aa  101  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  92.59 
 
 
108 aa  100  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  86.21 
 
 
166 aa  100  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  92.59 
 
 
80 aa  99.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  92.59 
 
 
114 aa  100  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  65.12 
 
 
382 aa  99.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  87.72 
 
 
382 aa  99.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  90.91 
 
 
373 aa  99.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  90.74 
 
 
95 aa  99  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  90.91 
 
 
172 aa  98.2  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  92.59 
 
 
260 aa  98.2  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  89.47 
 
 
383 aa  97.8  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  94.34 
 
 
87 aa  97.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  92.45 
 
 
75 aa  96.3  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  88.89 
 
 
183 aa  94.7  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  82.76 
 
 
358 aa  94.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  81.97 
 
 
82 aa  94.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  85.71 
 
 
107 aa  92.8  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  85.19 
 
 
106 aa  90.5  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  82.14 
 
 
113 aa  89.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  82.14 
 
 
93 aa  90.1  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.84 
 
 
958 aa  86.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0118  hypothetical protein  81.48 
 
 
120 aa  83.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.899916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.18 
 
 
833 aa  80.9  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3217  hypothetical protein  78.95 
 
 
79 aa  63.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338224  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3040  hypothetical protein  63.27 
 
 
368 aa  59.7  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.119269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1733  hypothetical protein  72.97 
 
 
119 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  27.13 
 
 
1076 aa  55.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2497  hypothetical protein  83.87 
 
 
171 aa  55.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0450  hypothetical protein  83.87 
 
 
171 aa  55.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3087  hypothetical protein  81.25 
 
 
123 aa  52.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.678329  normal  0.149098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  57.38 
 
 
172 aa  51.6  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  26.78 
 
 
991 aa  51.2  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  38.4 
 
 
167 aa  51.2  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1973  hypothetical protein  95.83 
 
 
85 aa  48.9  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.53 
 
 
277 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2411  hypothetical protein  92 
 
 
125 aa  47.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  91.67 
 
 
226 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4140  hypothetical protein  85.19 
 
 
173 aa  46.6  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442904  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  33.33 
 
 
865 aa  46.6  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  51.47 
 
 
104 aa  47  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  42.05 
 
 
336 aa  46.2  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  53.33 
 
 
121 aa  46.2  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.69 
 
 
989 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  27.01 
 
 
990 aa  45.8  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2403  hypothetical protein  91.67 
 
 
121 aa  45.8  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152355  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  47.14 
 
 
514 aa  45.8  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  29.61 
 
 
1001 aa  45.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  52.54 
 
 
514 aa  44.7  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  43.24 
 
 
105 aa  44.3  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>