More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0966 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0966  porin  100 
 
 		 355 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  69.28 
 
 		 339 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  44.17 
 
 		 368 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  41.22 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  43.01 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  40.1 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  41.71 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  42.22 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  41.88 
 
 		 375 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  41.06 
 
 		 344 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  38.26 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  38.69 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  41.03 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  40.27 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  40.96 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  39.52 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  35.73 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  37.4 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  35.16 
 
 		 374 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  37.1 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  36.34 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  36.24 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  33.98 
 
 		 355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  35.41 
 
 		 454 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  34.93 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.17 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  33.14 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  32.78 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  31.47 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  32.15 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  34.36 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.15 
 
 		 358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  33.02 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  32.1 
 
 		 341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  32.91 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.13 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.99 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.47 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  32.52 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  30.79 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.99 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  30.79 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  30.79 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.72 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.81 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  31.17 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  30.77 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  30.51 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.84 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  30.51 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  30.51 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  31.44 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  31.66 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  29.57 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  30.67 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  30.81 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  33.71 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  33.71 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  31.47 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  30.43 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  30.43 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  33.94 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  30.65 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  31.02 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31 
 
 		 344 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  30.93 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  30.79 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  30.93 
 
 		 363 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  33.86 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  33.86 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  47.97 
 
 		 220 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  30.19 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.16 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  33.24 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  32.82 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  30.25 
 
 		 329 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  30.31 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  29.74 
 
 		 347 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  29.61 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  30.23 
 
 		 383 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  30.51 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  28.73 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  29.06 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  29.06 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  29.06 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  29.4 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  32.51 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  29.06 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  30.25 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  29.28 
 
 		 417 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  28.31 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  29.04 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  29.77 
 
 		 327 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  29.13 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  31.99 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  28.87 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  32.34 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  31.99 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  31.68 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  31.14 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>