More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6530 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  100 
 
 		 417 aa  829    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0949  outer membrane protein (porin)-like  36.83 
 
 		 390 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4766  porin  35.01 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5517  porin  35.01 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3601  porin  35.01 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5897  outer membrane protein (porin)-like protein  36.16 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0466663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.77 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1963  porin  31.92 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.513284 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.17 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  32.96 
 
 		 350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  32.96 
 
 		 350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  32.77 
 
 		 350 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  33.51 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  31.75 
 
 		 371 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30.42 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  29.33 
 
 		 356 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  32.86 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  28.97 
 
 		 356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  28.97 
 
 		 356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  30.63 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  28.24 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  30.05 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  28.24 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  28.69 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  33.49 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  29.37 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  31.28 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30.65 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  29.41 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  28.99 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  31.13 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  31.13 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  29.44 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  29.78 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  29.02 
 
 		 393 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  30.79 
 
 		 372 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  30.49 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  29.53 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  32.97 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  27.85 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2997  porin  27.16 
 
 		 379 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  30.66 
 
 		 384 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  28.64 
 
 		 397 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  30.05 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  29.24 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  29.24 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  27.27 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  29.24 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  30.62 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  29.02 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  27.88 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  30.62 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  30.84 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  30.62 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  30.64 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  33.17 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  30.23 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.53 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.53 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  27.67 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  28.89 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  33.85 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  31.07 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  33.72 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  31.06 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  29.16 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  31.16 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  33.33 
 
 		 380 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  32.75 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2702  hypothetical protein  27.25 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  27.98 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  31.9 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3050  hypothetical protein  26.95 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  29.24 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0299  OmpC family outer membrane porin  29.55 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.882508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  38.59 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  30.43 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  31.17 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  38.59 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  32.09 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  28.12 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  26.16 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  29.6 
 
 		 355 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  28.01 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  27.73 
 
 		 496 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  31.39 
 
 		 380 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  29.83 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  29.28 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  29.59 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  29.59 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  30.23 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  31.46 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  30.45 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  30.45 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  30.45 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  28.91 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  30.45 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  28.72 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  26.77 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>