More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2179 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  97.38 
 
 		 344 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  95.35 
 
 		 344 aa  647    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  100 
 
 		 344 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  36.36 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  33.24 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  31.49 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  28.57 
 
 		 354 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.94 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  27.95 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  30.32 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  28.94 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  28.94 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  33.47 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  29.38 
 
 		 353 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  31.56 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  27.05 
 
 		 348 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  37.17 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  27.7 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  30.77 
 
 		 379 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  30.77 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  31.38 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  29.36 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  31.23 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  28.89 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  30.47 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  30.22 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  27.25 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  28.48 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  29.33 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  28.97 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  29.22 
 
 		 358 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  29.04 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  29.33 
 
 		 383 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  29.09 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  26.65 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  27.42 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  31.82 
 
 		 413 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  31.09 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  32.11 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  28.24 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  28.02 
 
 		 377 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  28.92 
 
 		 352 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  27.16 
 
 		 426 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.18 
 
 		 379 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  30.53 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  28.01 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.95 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  28.35 
 
 		 382 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2566  porin  31.62 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957532 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  27.58 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  29.51 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  27.87 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  29.51 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  35.03 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  27.45 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  30.17 
 
 		 414 aa  92.8  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  27.75 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  29.23 
 
 		 383 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  32.26 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  31.77 
 
 		 314 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  32.26 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  28.84 
 
 		 385 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  30.54 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  30.23 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  27.98 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  28.35 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.72 
 
 		 358 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  34.78 
 
 		 430 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  28.35 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  28.26 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  28.26 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  31.33 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  29.63 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  27.62 
 
 		 356 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  28.61 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  28.26 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  29.63 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  27.27 
 
 		 358 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  29.63 
 
 		 449 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  29.67 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  34.24 
 
 		 430 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  37.18 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  34.24 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  27.55 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  36.02 
 
 		 430 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  36.02 
 
 		 430 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  32.8 
 
 		 380 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  36.02 
 
 		 430 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  27.99 
 
 		 368 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  29.97 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  27.53 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  27.53 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  27.53 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  27.73 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  26.5 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  27.63 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  26.61 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  27.6 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  26.43 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  30 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>