More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0650 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0650  porin  100 
 
 		 369 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  44.18 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  39.58 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  38.99 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  36.72 
 
 		 352 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0747  porin  39.29 
 
 		 386 aa  196  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00334345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  36.03 
 
 		 360 aa  185  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  35.19 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  36.14 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  36.36 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  40.27 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  40.27 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  40.27 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  40.27 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  40.27 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  40.27 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  32.72 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  39.59 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  39.93 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  36.34 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  35.33 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  35.89 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  35.77 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  35.89 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  31.99 
 
 		 359 aa  139  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  36.64 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  33.74 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  35.6 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  35.6 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  36.09 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  33.08 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  34.26 
 
 		 426 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  35.33 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  35.33 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  32.24 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  32.24 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  35.33 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  35.85 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.06 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  32.56 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  35.85 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  38.16 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  35.33 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  35.85 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  35.56 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  36.84 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  37.53 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  33.8 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  37.26 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  34.25 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  34.17 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  32.51 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  31.89 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  33.09 
 
 		 386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  31.39 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.69 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  36.24 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  35.22 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.69 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.69 
 
 		 383 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  33.68 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.48 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  33.68 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  32.04 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  36.36 
 
 		 380 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  34.52 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  32.79 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  35.23 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  33.78 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.75 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  32.47 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  35.23 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  36.56 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  35.66 
 
 		 384 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  34.58 
 
 		 361 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  35.22 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  34.16 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  32.32 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  32.93 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  34.91 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  35.23 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  34.25 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  35.03 
 
 		 385 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  34.69 
 
 		 445 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  33.94 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  33.59 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  31.94 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  34.69 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  33.69 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  33.83 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  36.34 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  31.98 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  39.02 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  36.78 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  34.41 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  32.98 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  35.2 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  34.46 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  37.18 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  32.97 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>