More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4327 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4216  porin  91.84 
 
 		 380 aa  704    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  91.84 
 
 		 380 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  89.21 
 
 		 380 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  97.11 
 
 		 380 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  100 
 
 		 380 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  86.05 
 
 		 380 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  99.74 
 
 		 379 aa  739    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  75.79 
 
 		 411 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  66.75 
 
 		 384 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  67.01 
 
 		 384 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  66.75 
 
 		 384 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  66.75 
 
 		 384 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  67.01 
 
 		 384 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  66.23 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  66.23 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  61.92 
 
 		 383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  62.34 
 
 		 383 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  60.51 
 
 		 390 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  64.56 
 
 		 383 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  63.43 
 
 		 409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  59.59 
 
 		 391 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  54.04 
 
 		 379 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  54.18 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  53.3 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.79 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.79 
 
 		 379 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.79 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.54 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.79 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.65 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.64 
 
 		 381 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.02 
 
 		 379 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.53 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  52.27 
 
 		 380 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 		 383 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.62 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.12 
 
 		 381 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 		 384 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  51.19 
 
 		 379 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.5 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  49.23 
 
 		 375 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  50 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  48.71 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  48.71 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  50.13 
 
 		 384 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47.75 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47.75 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47.75 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47.75 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47.75 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47.75 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47.75 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47.5 
 
 		 414 aa  322  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.87 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  49.46 
 
 		 375 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  49.12 
 
 		 392 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.1 
 
 		 377 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47.62 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  49.23 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  47.37 
 
 		 409 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  47.37 
 
 		 409 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  47.26 
 
 		 387 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  44.16 
 
 		 376 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  46.17 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.08 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.59 
 
 		 363 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  45.09 
 
 		 385 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.17 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.17 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.17 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  44.44 
 
 		 381 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  45.45 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.53 
 
 		 396 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.38 
 
 		 384 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  45.12 
 
 		 384 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  44.72 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  44.96 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  44.96 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  44.96 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  45.11 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  48.07 
 
 		 362 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  48.07 
 
 		 362 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  48.07 
 
 		 362 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  45.12 
 
 		 384 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  48.84 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.88 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  47.06 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  47.06 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  45.71 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  42.37 
 
 		 386 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.58 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.71 
 
 		 385 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  47.57 
 
 		 374 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  48.35 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.92 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  48.35 
 
 		 372 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.92 
 
 		 383 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.68 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.68 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>