More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2206 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  100 
 
 		 387 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  68.87 
 
 		 392 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0328  OmpC family outer membrane porin  56.86 
 
 		 380 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000489556  normal  0.173694 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4872  porin  53.02 
 
 		 386 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0644122  normal  0.66467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  46.63 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  45.91 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  47.03 
 
 		 383 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  45.26 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  45.39 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.44 
 
 		 436 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  44.21 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  43.95 
 
 		 436 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  42.75 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  43.72 
 
 		 379 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.73 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.73 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.73 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.73 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  41.92 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.73 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  41.67 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  44.24 
 
 		 385 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  45.31 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  45.31 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  45.31 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  45.31 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  45.31 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  45.31 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  45.31 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  42.74 
 
 		 374 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.47 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.99 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.99 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  45.31 
 
 		 414 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  41.76 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  42.42 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  44.36 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  42.59 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  40.66 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  43.44 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  43.09 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  43.08 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  43.08 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  43.08 
 
 		 384 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  43.85 
 
 		 383 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  43.3 
 
 		 384 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.68 
 
 		 389 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  44.24 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  43.64 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.59 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.59 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  44.54 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.04 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  44.54 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  43.8 
 
 		 389 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  43.56 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  40.6 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  43.08 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  43.08 
 
 		 380 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  43.46 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.46 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  39.65 
 
 		 379 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  39.9 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  41.56 
 
 		 381 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  41.77 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  41.52 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  39.65 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  39.65 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  42.01 
 
 		 380 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  39.65 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  40.55 
 
 		 381 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  42.74 
 
 		 389 aa  255  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  39.14 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  43.01 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  43.01 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  41.01 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  41.08 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  39.7 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  40.91 
 
 		 384 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  42.71 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  42.71 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  42.71 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  40.83 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  40.83 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  42.71 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  42.71 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.85 
 
 		 383 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  42.11 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  42.46 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  42.56 
 
 		 384 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  40.4 
 
 		 384 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  39.79 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  39.69 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  39.79 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  40 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  40.34 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  40.16 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  41.89 
 
 		 377 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  42.09 
 
 		 523 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  41.71 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>