More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0452 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  89.87 
 
 		 383 aa  683    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  100 
 
 		 385 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  88.31 
 
 		 383 aa  674    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  89.61 
 
 		 383 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  89.61 
 
 		 383 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  91.26 
 
 		 389 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  99.74 
 
 		 385 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  81.14 
 
 		 436 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  81.14 
 
 		 386 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  81.14 
 
 		 386 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  81.14 
 
 		 386 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  80.62 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  81.14 
 
 		 386 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  81.14 
 
 		 386 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  80.88 
 
 		 386 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  77.18 
 
 		 389 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  76.67 
 
 		 389 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  68.8 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  63.84 
 
 		 395 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  64.09 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  57.14 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  56.3 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  54.73 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  57 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  58.99 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  55.42 
 
 		 400 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  54.19 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  50.85 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  51.51 
 
 		 391 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  50.38 
 
 		 389 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  49.25 
 
 		 383 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  51.48 
 
 		 398 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  48.61 
 
 		 389 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  51.12 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  47.1 
 
 		 409 aa  328  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  48.36 
 
 		 393 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  51.86 
 
 		 352 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  48.37 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  48.37 
 
 		 383 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  46.17 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  46.17 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  46.17 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  46.17 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  45.66 
 
 		 386 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  46.17 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  49.88 
 
 		 414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  49.63 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  49.63 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  49.63 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  49.63 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  49.63 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  49.63 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  49.63 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  48.86 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  47.76 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  46.14 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  46.19 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  47.04 
 
 		 396 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  46.45 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  48.11 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  46.04 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  47.41 
 
 		 381 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.9 
 
 		 381 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  49.47 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  47.7 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  45.38 
 
 		 378 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  44.53 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  46.61 
 
 		 366 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  46.61 
 
 		 366 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  47.36 
 
 		 390 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  46.91 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  44 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  45.41 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  49.25 
 
 		 384 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  49 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  44 
 
 		 397 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  44 
 
 		 421 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  45.66 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.25 
 
 		 384 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  45.41 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  49 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  49 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  49 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  46.15 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  43.49 
 
 		 397 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  46.59 
 
 		 366 aa  295  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  48.16 
 
 		 385 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  45.66 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  45.66 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  47.52 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  46.85 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  46.17 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  46.65 
 
 		 394 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47.63 
 
 		 391 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  43.8 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  47.28 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  48.57 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  46.13 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  47.63 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  47.63 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>