More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2847 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0452  porin  91.26 
 
 
385 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  100 
 
 
389 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  88.43 
 
 
383 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  91.52 
 
 
385 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  88.69 
 
 
383 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  89.2 
 
 
383 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  88.69 
 
 
383 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  80.51 
 
 
386 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  80.51 
 
 
386 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  80.51 
 
 
386 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  80.51 
 
 
436 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  80.51 
 
 
386 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  80.51 
 
 
386 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  79.74 
 
 
436 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  80.26 
 
 
386 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  75.26 
 
 
389 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  75 
 
 
389 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  69.53 
 
 
402 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  64.76 
 
 
395 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  64.34 
 
 
391 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  56.97 
 
 
400 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  57 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  56.56 
 
 
389 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  54.41 
 
 
396 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  55.75 
 
 
400 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  54.28 
 
 
400 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  57.22 
 
 
403 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  51.5 
 
 
391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  50.96 
 
 
408 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  47.58 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  51.22 
 
 
398 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  49.75 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  48.51 
 
 
389 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  49.38 
 
 
381 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.67 
 
 
383 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  49.63 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  52.27 
 
 
352 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  48.12 
 
 
393 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.13 
 
 
383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  47.21 
 
 
379 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  45.45 
 
 
386 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  47.49 
 
 
386 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  46.86 
 
 
409 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  48.16 
 
 
384 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  48.16 
 
 
384 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  48.16 
 
 
384 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47.93 
 
 
414 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  48.16 
 
 
384 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  48.16 
 
 
384 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  48.16 
 
 
384 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  48.16 
 
 
384 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  46.19 
 
 
378 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  46.29 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  47 
 
 
387 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  44.5 
 
 
399 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  46.1 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  44.5 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  44.5 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  44.5 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  44.5 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  47.75 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  49.34 
 
 
390 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  49.21 
 
 
390 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  46.75 
 
 
390 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  47.38 
 
 
384 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  45.73 
 
 
386 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  49.35 
 
 
393 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  49.19 
 
 
385 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  44.12 
 
 
397 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  47.46 
 
 
412 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  44.79 
 
 
422 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  45.73 
 
 
386 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  44.72 
 
 
391 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  45.73 
 
 
386 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  43.87 
 
 
421 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  47 
 
 
390 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  43.87 
 
 
421 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.65 
 
 
384 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  47.36 
 
 
430 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  45.23 
 
 
386 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  47.36 
 
 
430 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  49.36 
 
 
393 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  45.23 
 
 
386 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  45.76 
 
 
386 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  43.63 
 
 
397 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  47.13 
 
 
430 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  47.1 
 
 
390 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  47.36 
 
 
430 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  48.15 
 
 
384 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  48.28 
 
 
390 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  48.28 
 
 
390 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  47.36 
 
 
430 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  47.36 
 
 
430 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.19 
 
 
381 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  46.5 
 
 
380 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  48.01 
 
 
390 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  43.63 
 
 
397 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  46.6 
 
 
385 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  45.95 
 
 
381 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  44.12 
 
 
397 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>