More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1202 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 361 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  63.28 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  60.4 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  60.4 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  60.22 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2457  porin  59.15 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0201668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  57.69 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  57.69 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  56.45 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  55.49 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  55.49 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  55.21 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  55.49 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7310  outer membrane protein (porin)  44.74 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  0.523788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  43.3 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  38.67 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  38.6 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  34.89 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  34.99 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  34.16 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6355  porin  32.01 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  35.92 
 
 		 367 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  36.76 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3095  putative outer membrane porin  33.05 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1434  putative porin protein  33.05 
 
 		 379 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2036  putative outer membrane porin  33.05 
 
 		 375 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1060  putative outer membrane porin  33.05 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1346  putative outer membrane porin  33.05 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.80313  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2327  putative outer membrane porin  33.05 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.61 
 
 		 358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  34.94 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  30.67 
 
 		 361 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  33.6 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  30.93 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.75 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  30.93 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  30.93 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.38 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.38 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1917  porin  36.58 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  32.18 
 
 		 363 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  36.84 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  35.55 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.78 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  34.84 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  36.21 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  34.51 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  34.01 
 
 		 390 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  34.51 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  34.51 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  34.43 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  35.4 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.37 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  35.44 
 
 		 380 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  34.76 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  33.76 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  34.76 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  34.76 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  36.55 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  34.76 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.88 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2332  outer membrane porin  34.9 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  34.38 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  36.55 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  33.63 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2373  outer membrane porin  34.9 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14449  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  35.55 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2489  outer membrane porin  34.9 
 
 		 421 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  31.01 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  35.55 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1929  porin  34.81 
 
 		 348 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6150  porin  35.1 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  35.42 
 
 		 385 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  34.81 
 
 		 362 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.27 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  34.29 
 
 		 369 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  34.5 
 
 		 386 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  34.5 
 
 		 386 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  34.6 
 
 		 386 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  35.42 
 
 		 385 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  31.93 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  34.58 
 
 		 379 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  33.62 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.21 
 
 		 363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  35.92 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  35.92 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  30.43 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1473  outer membrane porin, putative  34.6 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  34.13 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1952  porin  35.12 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0650784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  30.43 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1343  porin  34.72 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  34.49 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  33.25 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  35.03 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1966  porin  34.6 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1240  porin  34.6 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3339  porin  34.6 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.205333  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  35.26 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  33.5 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>