More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3532 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3532  porin  100 
 
 		 350 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  39.58 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  37.7 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  38.72 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  37.09 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  35.81 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  34.69 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0747  porin  32.58 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00334345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.88 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.53 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  35.05 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  33.81 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  32.59 
 
 		 348 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  31.65 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  33 
 
 		 372 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  32.86 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  33.44 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  30.55 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  31.46 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  30.91 
 
 		 349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  32.66 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  32.71 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  32.4 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  33.33 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  32.19 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  33.03 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  32.5 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  32.55 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  32.5 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  32.5 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  30.98 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  32.96 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  29.69 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  32.4 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  32.19 
 
 		 351 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  31.09 
 
 		 340 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  29.74 
 
 		 400 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  31.52 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  31.56 
 
 		 381 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  31.84 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  31.84 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  32.33 
 
 		 399 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  31.66 
 
 		 387 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  30.9 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  31.66 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  31.04 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  31.35 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  32.01 
 
 		 342 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  36.77 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  36.77 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  36.77 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  32.32 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  36.77 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  36.77 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  36.77 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  29.65 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.37 
 
 		 385 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  36.77 
 
 		 436 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  29.68 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.37 
 
 		 385 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  29.41 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  33.23 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  29.07 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  36.32 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  30 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  31.98 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  31.12 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  30.92 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  29.75 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  31.09 
 
 		 386 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  31.44 
 
 		 397 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  31.56 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  30.42 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.44 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  31.05 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  31.78 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  30.99 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  30.18 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  37.98 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  36.19 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  35.87 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  31.83 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31.93 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  28.18 
 
 		 384 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  29.9 
 
 		 431 aa  96.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  30.61 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  30.26 
 
 		 421 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  30.26 
 
 		 421 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  36.94 
 
 		 430 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  37.09 
 
 		 430 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  37.09 
 
 		 430 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  35.87 
 
 		 395 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  31.01 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  30.56 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  37.5 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  30.09 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  35.43 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  29.91 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  29.35 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  37.2 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>