More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1304 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1304  porin  100 
 
 		 349 aa  687    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  53.78 
 
 		 368 aa  328  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  51.82 
 
 		 355 aa  306  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  44.55 
 
 		 387 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  47.52 
 
 		 385 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  48.19 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  45.22 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  43.06 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  42.05 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  41.72 
 
 		 431 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  45.14 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  42.45 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  39.58 
 
 		 362 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  39.79 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  42.19 
 
 		 355 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  39.89 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  40.33 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  39.5 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  40.22 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  39.77 
 
 		 454 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  38.44 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  36.27 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  37.53 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  38.59 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  36.57 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  33.6 
 
 		 370 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  35.04 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  34.65 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  33.16 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  34.91 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  34.48 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  31.57 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  35.85 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  33.24 
 
 		 352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  34.58 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.39 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  48.7 
 
 		 220 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  33.42 
 
 		 354 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  30.68 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  30.91 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.35 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.97 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  31.7 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.35 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.7 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  29.97 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  31.12 
 
 		 344 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  31.61 
 
 		 344 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.12 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.12 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.12 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.83 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  28.97 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.59 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.27 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  30.75 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.46 
 
 		 392 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  32.87 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.65 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  30.21 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  30.11 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  32.73 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  33.62 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4956  porin  32.68 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  30.45 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  32.63 
 
 		 352 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  32.63 
 
 		 352 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.23 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  30.19 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  29.83 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  29.55 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  29.55 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  29.89 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  31.8 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.22 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  32.09 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.22 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  28.99 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  30.97 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  29.5 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  29.78 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  32.31 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  33.54 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  30.29 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  31.39 
 
 		 353 aa  99.8  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  30.29 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4315  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  30.53 
 
 		 357 aa  99.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  30.92 
 
 		 384 aa  99.4  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  30.34 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  32.34 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  29.43 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  30.51 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  28.42 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  28.42 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.45 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  30.4 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  27.87 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  30.03 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  29.92 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  29.95 
 
 		 402 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>