More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1125 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1125  porin  100 
 
 
341 aa  695    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  79.77 
 
 
340 aa  543  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  57.23 
 
 
342 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  43.47 
 
 
359 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  40.79 
 
 
361 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  43.71 
 
 
351 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  43.73 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  43.43 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  43.98 
 
 
352 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  43.98 
 
 
352 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  40.06 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  39.77 
 
 
344 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  39.66 
 
 
344 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  40.54 
 
 
358 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  40 
 
 
357 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  40 
 
 
357 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  40.6 
 
 
358 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  40.24 
 
 
358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  40.24 
 
 
358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  40.24 
 
 
358 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  40.3 
 
 
358 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  40 
 
 
357 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  40 
 
 
357 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  40 
 
 
358 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  39.41 
 
 
357 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  38.14 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  39.58 
 
 
387 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  39.58 
 
 
358 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  39.58 
 
 
358 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  38.6 
 
 
357 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  38.01 
 
 
357 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  37.29 
 
 
363 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  38.66 
 
 
367 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  36.2 
 
 
362 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  38.25 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  39.56 
 
 
332 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  37.46 
 
 
361 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  37.36 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  32.85 
 
 
341 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  35.61 
 
 
365 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  34.55 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  37.4 
 
 
344 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  33.42 
 
 
339 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  32.7 
 
 
352 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.99 
 
 
369 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  35.04 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  33.24 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  35.47 
 
 
335 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  33.63 
 
 
374 aa  126  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  33.07 
 
 
360 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  32.52 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  31.21 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  32.23 
 
 
350 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.91 
 
 
335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  34 
 
 
370 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  35.78 
 
 
360 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  32.78 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  31.23 
 
 
350 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  33.94 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  32 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  32.11 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  31.51 
 
 
350 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  31.51 
 
 
350 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  31.23 
 
 
350 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  32.15 
 
 
367 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  31.15 
 
 
354 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  32.61 
 
 
344 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  35.06 
 
 
360 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  33.15 
 
 
414 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  31.39 
 
 
329 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  29.93 
 
 
400 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1592  putative outer membrane protein (porin)  31.94 
 
 
383 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  29.18 
 
 
372 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  27.62 
 
 
348 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  32.13 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  28.13 
 
 
382 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  30.24 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  28.57 
 
 
431 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  28.26 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.88 
 
 
385 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.88 
 
 
385 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  32.31 
 
 
375 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4315  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  31.93 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320108  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  31.45 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  29.82 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  30.75 
 
 
355 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  29.57 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  31.11 
 
 
417 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0171  porin  28.24 
 
 
332 aa  93.2  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  29.27 
 
 
352 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  29.89 
 
 
351 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  30.49 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  29.68 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  31.08 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.71 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.71 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  31.08 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  26.78 
 
 
346 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  32.36 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  29.9 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>