More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5627 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5627  porin  100 
 
 		 372 aa  733    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  45.08 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  41.92 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  36.53 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  36.48 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  35.28 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  35.19 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  35.13 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  35.61 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  35.55 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  35.79 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  36.36 
 
 		 385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  32.12 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  36.52 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  34.58 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  33.33 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  36.39 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  33.16 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  33.1 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  34.18 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  35.98 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  35.15 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  32.99 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  33.93 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  34.28 
 
 		 454 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.33 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.45 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  32.47 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  31.65 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  31.71 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  28.43 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  37.23 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  29.01 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  28.12 
 
 		 382 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  30.12 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  27.15 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  30.79 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  30.79 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.73 
 
 		 367 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  30.18 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  30 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  30 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  30 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.94 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  30.82 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.94 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.94 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3601  porin  29.35 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.94 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5517  porin  29.35 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.94 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  26.17 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.94 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4766  porin  29.35 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.78 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  27.2 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.65 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  27.64 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  29.8 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  30.74 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  34.92 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  33.82 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  28.46 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  33.82 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  30.92 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  40.56 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4956  porin  29.74 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  27.79 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  27.99 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  27.99 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  33.05 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  34.78 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5897  outer membrane protein (porin)-like protein  29.08 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0466663 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  34.78 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  38.58 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  27.79 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  34.78 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  27.6 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  27.25 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  26.7 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1354  porin  27.96 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  29.93 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  35.68 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  38.58 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  44.35 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  44.35 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  34.12 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  28.69 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  34.22 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  44.35 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  26.4 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  33.53 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  33.53 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  33.53 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  26.4 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  26.4 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  33.53 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  37.7 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  33.93 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3103  porin  38.52 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>