More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2943 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  99.74 
 
 
379 aa  755    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  99.47 
 
 
379 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  99.74 
 
 
379 aa  755    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  83.29 
 
 
383 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  83.55 
 
 
383 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  95.78 
 
 
379 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  100 
 
 
379 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  99.74 
 
 
379 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  83.16 
 
 
374 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  75.33 
 
 
381 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  74.02 
 
 
379 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  74.28 
 
 
380 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  74.54 
 
 
380 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  72.06 
 
 
381 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  69.19 
 
 
381 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  69.71 
 
 
381 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  57.96 
 
 
379 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  57.3 
 
 
376 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  54.7 
 
 
391 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  53.21 
 
 
383 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  53.73 
 
 
383 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  54.39 
 
 
390 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  52.03 
 
 
380 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  52.39 
 
 
384 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  52.39 
 
 
384 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  51.52 
 
 
380 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  52.14 
 
 
384 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  51.78 
 
 
380 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.94 
 
 
384 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  52.54 
 
 
380 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  51.06 
 
 
411 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  51.72 
 
 
392 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  52.53 
 
 
383 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  53.2 
 
 
384 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  53.2 
 
 
384 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  53.2 
 
 
384 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  53.2 
 
 
384 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  53.2 
 
 
384 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  53.2 
 
 
384 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  53.2 
 
 
384 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  51.02 
 
 
380 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  52.28 
 
 
379 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  54.64 
 
 
383 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  51.02 
 
 
380 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  51.79 
 
 
384 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  52.43 
 
 
414 aa  358  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  50.13 
 
 
384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  52.05 
 
 
384 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  54.01 
 
 
409 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  51.54 
 
 
384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  50.26 
 
 
384 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  50.26 
 
 
384 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  50.26 
 
 
384 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  49.36 
 
 
383 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  51.28 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
386 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  49.49 
 
 
394 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  48.74 
 
 
394 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  49.37 
 
 
383 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  49.62 
 
 
386 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  49.11 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  49.87 
 
 
381 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  51.15 
 
 
375 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  51.28 
 
 
375 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  50.67 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  48.09 
 
 
383 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  49.87 
 
 
386 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  49.06 
 
 
385 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  49.59 
 
 
386 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  52.07 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47.63 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  52.07 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  52.07 
 
 
362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  50 
 
 
375 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  50 
 
 
375 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  48.84 
 
 
375 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  47.13 
 
 
409 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  47.13 
 
 
409 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  48.34 
 
 
383 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  52.47 
 
 
361 aa  315  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  46.59 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  49.62 
 
 
374 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  49.62 
 
 
374 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  49.62 
 
 
374 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  49.87 
 
 
376 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
376 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
376 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
376 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.52 
 
 
363 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  49.37 
 
 
374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  46.68 
 
 
383 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  51.53 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  45.14 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  51.15 
 
 
372 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  51.15 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>