More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5151 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4625  porin  98.65 
 
 		 370 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0385  outer membrane protein (porin)  94.32 
 
 		 370 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5264  porin  95.14 
 
 		 370 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3103  porin  95.14 
 
 		 370 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  100 
 
 		 370 aa  754    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5009  porin  95.41 
 
 		 370 aa  729    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  44.83 
 
 		 370 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  43.23 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3186  porin  46.24 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  44.97 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.61 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  42.89 
 
 		 374 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.36 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  44.33 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  43.72 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  42.49 
 
 		 379 aa  256  4e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  43.46 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  41.77 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  42.46 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  41.52 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  41.52 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  41.52 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.43 
 
 		 375 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  44.33 
 
 		 380 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  41.27 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.16 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.16 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2630  OmpC family outer membrane porin  41.26 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4523  OmpC family outer membrane porin  41.26 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000520547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  42.28 
 
 		 375 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  41.69 
 
 		 383 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  43.8 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  42.03 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  41.53 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.96 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  41.27 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6220  porin  40.94 
 
 		 397 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.811585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  41.15 
 
 		 381 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6389  porin  40.68 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.108998  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6622  porin  40.68 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  41.19 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  42.07 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.36 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  41.71 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  40.26 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  40.66 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  40.62 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  40.59 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  40.76 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  40.76 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.35 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  39.19 
 
 		 394 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  39.15 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  39.15 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  39.9 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  40.52 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.13 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  41.78 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.13 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.13 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.13 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.13 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.13 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.13 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  40.55 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  39.07 
 
 		 380 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  40.4 
 
 		 384 aa  229  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  37.66 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  42.98 
 
 		 414 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  38.5 
 
 		 387 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  39.08 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  37.34 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  43.39 
 
 		 384 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  37.34 
 
 		 394 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  37.34 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  43.39 
 
 		 384 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  43.39 
 
 		 384 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  39.65 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  43.97 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  39.65 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.46 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  38.22 
 
 		 403 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  39.74 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  39.22 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  39.22 
 
 		 383 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.08 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  39.5 
 
 		 385 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  39.34 
 
 		 381 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  39.39 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  39.39 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  39.39 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  42.12 
 
 		 383 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  37.59 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  39.06 
 
 		 384 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  38.62 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  38.96 
 
 		 383 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  38.44 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  40 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  38.36 
 
 		 385 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  36.9 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>