More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6314 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6314  porin  100 
 
 		 377 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  53.83 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  47.78 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  51.23 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  49.87 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  49.61 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  52.32 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  51.23 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  49.61 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  51.23 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.96 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  51.23 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  51.23 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  49.61 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  51.23 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  51.23 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  50.65 
 
 		 384 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  50.13 
 
 		 384 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  52.73 
 
 		 384 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  49.45 
 
 		 386 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  49.34 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  49.17 
 
 		 385 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  47.55 
 
 		 396 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  48.29 
 
 		 383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  50.13 
 
 		 383 aa  339  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  47.78 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  49.16 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  48.56 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  49.6 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  49.08 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  49.34 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  49.34 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  48.42 
 
 		 375 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  45.76 
 
 		 383 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  46.02 
 
 		 383 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  46.81 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  48.72 
 
 		 379 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  49.59 
 
 		 380 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  47.93 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  48.46 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  48.61 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  45.14 
 
 		 379 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  45.03 
 
 		 379 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  49.32 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  45.14 
 
 		 379 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  45.14 
 
 		 379 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  45.14 
 
 		 379 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  45.14 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  47.67 
 
 		 383 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  40.85 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.11 
 
 		 381 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  47.01 
 
 		 384 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  47.18 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  45.74 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  44.53 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  47.31 
 
 		 381 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  46.74 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  45.6 
 
 		 382 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  45.6 
 
 		 382 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  43.92 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  42.27 
 
 		 386 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  44.78 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  42.78 
 
 		 380 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.78 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  43.58 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  44.27 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  43.11 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  42.36 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  44.13 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  44.13 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  42.25 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  44.13 
 
 		 391 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  45.89 
 
 		 376 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  45.31 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.19 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  42.38 
 
 		 380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.06 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  45.06 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  42.78 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  42.25 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  42.78 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  42.67 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  42.67 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  42.67 
 
 		 384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  42.67 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  42.67 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  44.59 
 
 		 409 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  43.73 
 
 		 383 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41.24 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  42.25 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  43.36 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.67 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  42.15 
 
 		 384 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  43.4 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  42.53 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  43.15 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  43.24 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  42.97 
 
 		 374 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  42.46 
 
 		 374 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.43 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>