More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0620 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  93.73 
 
 		 383 aa  720    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 383 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  79.69 
 
 		 384 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  74.61 
 
 		 384 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  58.75 
 
 		 375 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  58.75 
 
 		 375 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  57.44 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  57.44 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  58.9 
 
 		 375 aa  401  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  56.89 
 
 		 381 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  54.85 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  57.33 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  55.93 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  54.99 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  52.3 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  54.59 
 
 		 383 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  57.4 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  53.44 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  53.83 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  53.47 
 
 		 379 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  53.73 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  57.4 
 
 		 380 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  53.47 
 
 		 379 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  53.83 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  53.47 
 
 		 379 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  53.21 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  54.34 
 
 		 386 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  53.73 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  53.65 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  54.31 
 
 		 374 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  51.26 
 
 		 384 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  52.38 
 
 		 383 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  50.5 
 
 		 384 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  50.5 
 
 		 384 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  52.53 
 
 		 377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  50.25 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  50.25 
 
 		 384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  52 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  53.72 
 
 		 383 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  51.81 
 
 		 376 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  52.44 
 
 		 384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  51.16 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  51.41 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  51.41 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  51.41 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  51.41 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  51.41 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  51.41 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  51.41 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  51.37 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  49.62 
 
 		 380 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  51.53 
 
 		 391 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  51.01 
 
 		 377 aa  349  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  51.53 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  50.49 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  51.53 
 
 		 409 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  52.55 
 
 		 409 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  48.86 
 
 		 380 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  51.41 
 
 		 384 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  50 
 
 		 383 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  51.41 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  50.13 
 
 		 380 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  50.13 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  49.11 
 
 		 380 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  48.86 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  50.64 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  50.64 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  50.64 
 
 		 384 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  49.11 
 
 		 379 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  47.04 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  50.9 
 
 		 384 aa  335  7e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  46.39 
 
 		 471 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  46.53 
 
 		 398 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  46.27 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  46.27 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  47.36 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  45.41 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  45.92 
 
 		 418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  49.61 
 
 		 381 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  47.07 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  47.07 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  50.13 
 
 		 383 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  48 
 
 		 419 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  47.07 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  50.13 
 
 		 383 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  47.07 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  47.07 
 
 		 407 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  47.07 
 
 		 407 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  49.63 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  47.03 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  48.31 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  48.95 
 
 		 411 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  47.22 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.9 
 
 		 363 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  46.81 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  49.12 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  49.37 
 
 		 383 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.62 
 
 		 385 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>