More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2395 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0863  porin  89.47 
 
 
380 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  84.51 
 
 
381 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  89.21 
 
 
380 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  100 
 
 
379 aa  763    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  76.24 
 
 
383 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  76.24 
 
 
383 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  74.54 
 
 
379 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  74.54 
 
 
379 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  76.42 
 
 
374 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  74.54 
 
 
379 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  74.54 
 
 
379 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  74.28 
 
 
379 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  74.28 
 
 
379 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  72.77 
 
 
381 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  72.85 
 
 
381 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  72.32 
 
 
381 aa  521  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  61.25 
 
 
379 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  58.51 
 
 
376 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  56.19 
 
 
383 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  56.7 
 
 
383 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  55.3 
 
 
380 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  55.56 
 
 
380 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  53.88 
 
 
384 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  53.88 
 
 
384 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  54.14 
 
 
384 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  53.88 
 
 
384 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  52.78 
 
 
380 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  53.63 
 
 
384 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  53.88 
 
 
384 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  54.14 
 
 
384 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  52.93 
 
 
380 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  54.52 
 
 
390 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  54.04 
 
 
380 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  54.04 
 
 
379 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  53.03 
 
 
380 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  55.28 
 
 
392 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  53.88 
 
 
391 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  53.09 
 
 
384 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  54.29 
 
 
383 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  52.38 
 
 
411 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  54.64 
 
 
384 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  52.14 
 
 
384 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  53.32 
 
 
384 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  51.89 
 
 
414 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  52.96 
 
 
384 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  52.96 
 
 
384 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  52.96 
 
 
384 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  54.55 
 
 
383 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  51.65 
 
 
394 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  52.69 
 
 
384 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  52.3 
 
 
384 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  54.18 
 
 
409 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  50.77 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  49.49 
 
 
396 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  52.83 
 
 
384 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  50.76 
 
 
383 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  52.56 
 
 
375 aa  346  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  52.27 
 
 
391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  52.02 
 
 
409 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  49.1 
 
 
383 aa  342  7e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  52.02 
 
 
409 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  50.13 
 
 
386 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  50.26 
 
 
386 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  49.6 
 
 
386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  51.41 
 
 
375 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50.77 
 
 
375 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  50 
 
 
375 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  50 
 
 
375 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  49.33 
 
 
385 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  50 
 
 
386 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  48.36 
 
 
386 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  48.48 
 
 
383 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  50.51 
 
 
383 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.26 
 
 
363 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  48.61 
 
 
377 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47.58 
 
 
381 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48.98 
 
 
377 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  48.72 
 
 
377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  49.87 
 
 
362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  49.87 
 
 
362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  49.87 
 
 
362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  47.45 
 
 
387 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  50.77 
 
 
361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  49.62 
 
 
374 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  49.36 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  49.36 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  49.36 
 
 
374 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  49.37 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  49.37 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  49.37 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  49.37 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  45.01 
 
 
394 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  49.1 
 
 
374 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  49.87 
 
 
372 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>