More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2478 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 385 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  58.05 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  55.86 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  56.13 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  54.64 
 
 		 365 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  54.64 
 
 		 365 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  54.64 
 
 		 365 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  54.64 
 
 		 365 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  55.4 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  50.13 
 
 		 369 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  45.74 
 
 		 381 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  47.66 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  47.66 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  47.66 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  47.66 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  46.67 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  47.4 
 
 		 379 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  46.29 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  47.4 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  47.24 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  46.63 
 
 		 374 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  45.45 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.13 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  47.04 
 
 		 381 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  45.19 
 
 		 380 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  46.83 
 
 		 380 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  46.42 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  46.83 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  44.65 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  45.45 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  46.45 
 
 		 380 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  46.45 
 
 		 380 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  47.18 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  46.92 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  46.92 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  45.45 
 
 		 379 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  46.67 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  46.67 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  46.67 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  45.55 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  46.67 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  44.78 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  45.34 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  46.34 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  45.81 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  45.81 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  46.6 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  45.81 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.34 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.34 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  43.65 
 
 		 392 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  46.03 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  45.6 
 
 		 383 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  45.31 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  42.78 
 
 		 383 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  45.04 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  44.16 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  45.74 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  43.05 
 
 		 370 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  47.38 
 
 		 383 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  43.7 
 
 		 385 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.6 
 
 		 375 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  44.02 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.28 
 
 		 383 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  44.83 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.6 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.6 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.28 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.28 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  42.27 
 
 		 411 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  44.51 
 
 		 378 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.74 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  45.71 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  43.78 
 
 		 379 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  43.88 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  43.88 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  43.88 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  43.88 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  43.09 
 
 		 414 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  44.25 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  43.56 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  43.59 
 
 		 386 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  43.99 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  43.41 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  43.08 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  39 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  41.62 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  44.85 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  42.56 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  42.82 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  42.82 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  40.91 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  41.65 
 
 		 383 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  44.59 
 
 		 384 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  41.15 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.34 
 
 		 384 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  41.64 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>