More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3080 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0674  porin  87.96 
 
 		 381 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  97.9 
 
 		 381 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  100 
 
 		 381 aa  759    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  72.85 
 
 		 381 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  70.39 
 
 		 383 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  70.65 
 
 		 383 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  72.06 
 
 		 379 aa  518  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  69.45 
 
 		 379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  69.45 
 
 		 379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  69.19 
 
 		 379 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  69.45 
 
 		 379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  69.71 
 
 		 379 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  73.11 
 
 		 380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  73.63 
 
 		 380 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  69.95 
 
 		 374 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  68.67 
 
 		 379 aa  501  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  61.82 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  58.49 
 
 		 376 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  55.12 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  53.85 
 
 		 383 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  53.69 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  55.08 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  52.25 
 
 		 383 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  51.55 
 
 		 384 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  51.52 
 
 		 386 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  52.22 
 
 		 391 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  51.01 
 
 		 386 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  52.26 
 
 		 409 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  52.26 
 
 		 409 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  51.75 
 
 		 380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  52.26 
 
 		 391 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  51.63 
 
 		 390 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  52.25 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  52 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  51.5 
 
 		 380 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  50.51 
 
 		 384 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  52.25 
 
 		 379 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  51.41 
 
 		 375 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  51.38 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  51.38 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  51.38 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  51.38 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  51.38 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  51.38 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  51.38 
 
 		 384 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  50.25 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  51.52 
 
 		 386 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  50.25 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  51.25 
 
 		 380 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  51.25 
 
 		 380 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  50 
 
 		 384 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.88 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  49.62 
 
 		 375 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  50.25 
 
 		 384 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  48.86 
 
 		 383 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  51.34 
 
 		 383 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  50.13 
 
 		 381 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  48.98 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  49.61 
 
 		 411 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  48.59 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  48.59 
 
 		 375 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  49.87 
 
 		 384 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  48.74 
 
 		 384 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  48.74 
 
 		 384 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  48.74 
 
 		 384 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  49.24 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  50.81 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  51.48 
 
 		 409 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  49.37 
 
 		 384 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.34 
 
 		 383 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  47.45 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  48.36 
 
 		 394 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  49.87 
 
 		 386 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  50.76 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  50.76 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  50.76 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48.87 
 
 		 377 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  50.75 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  48.87 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  50.75 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  50.75 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  50.75 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  48.66 
 
 		 385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  50.51 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  48.64 
 
 		 384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  50 
 
 		 383 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  46.84 
 
 		 471 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  46.15 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  48.52 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  46.1 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.38 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  45.97 
 
 		 387 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.39 
 
 		 385 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.15 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  49.87 
 
 		 362 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  49.87 
 
 		 362 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  49.87 
 
 		 362 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>