More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7493 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7493  porin  100 
 
 		 383 aa  773    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  75.53 
 
 		 381 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  64.49 
 
 		 381 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  64.3 
 
 		 383 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  65.1 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  65.1 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  65.1 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  65.1 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  65.1 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  62.81 
 
 		 385 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  65.1 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  65.1 
 
 		 384 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  62.12 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  64.84 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  61.27 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  60.05 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  63.93 
 
 		 382 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  62.91 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  64.48 
 
 		 384 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  61.54 
 
 		 394 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  64.48 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  64.48 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  64.48 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  61.94 
 
 		 386 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  61.2 
 
 		 384 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  62.84 
 
 		 384 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  62.84 
 
 		 384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  51.8 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  49.48 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  50.82 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  49.87 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  44.3 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  46.06 
 
 		 389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  46.06 
 
 		 389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  47.73 
 
 		 383 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  47.47 
 
 		 383 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  47.84 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  48.09 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  47.84 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  47.84 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  47.84 
 
 		 379 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  48.51 
 
 		 382 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  48.51 
 
 		 382 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  45.8 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  48.55 
 
 		 374 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  47.03 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  47.18 
 
 		 381 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  46.77 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  47.72 
 
 		 380 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  47.11 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  46.94 
 
 		 379 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  47.72 
 
 		 380 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  48.94 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  46.62 
 
 		 381 aa  315  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  45.86 
 
 		 384 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.7 
 
 		 381 aa  316  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  44.74 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47.09 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.84 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  46.84 
 
 		 409 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  45.61 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  45.61 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  45.61 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  45.61 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.76 
 
 		 385 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  45.61 
 
 		 384 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.51 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.58 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  44.86 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  46.29 
 
 		 389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.84 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  46.65 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  45.15 
 
 		 380 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.13 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.98 
 
 		 383 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.98 
 
 		 383 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  45.99 
 
 		 375 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  48.32 
 
 		 389 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  45.87 
 
 		 379 aa  298  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.08 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  47.67 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.64 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.64 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.64 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.64 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.64 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.64 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.64 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  44.08 
 
 		 380 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  44.85 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  43.83 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  44.85 
 
 		 380 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.39 
 
 		 386 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.9 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  44.85 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  46.29 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  44.08 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  44.61 
 
 		 390 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  43.65 
 
 		 411 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>