More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5966 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5966  porin  100 
 
 		 380 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  57.38 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  57.38 
 
 		 382 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  54.79 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  55.24 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  51.42 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  51.16 
 
 		 389 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  51.42 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  52.42 
 
 		 386 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  52.05 
 
 		 382 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.42 
 
 		 383 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  49.04 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  49.04 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  49.04 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  48.77 
 
 		 384 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  48.49 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  48.22 
 
 		 384 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  48.63 
 
 		 386 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  48.38 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  48.38 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  48.38 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  48.38 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  48.38 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  48.38 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  48.38 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  47.41 
 
 		 385 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47.75 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47.57 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.74 
 
 		 383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  47.51 
 
 		 386 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  46.24 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  47.4 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.22 
 
 		 396 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  45.97 
 
 		 383 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.72 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  46.92 
 
 		 379 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  46.74 
 
 		 375 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  44.95 
 
 		 383 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  46.2 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  46.2 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  45.65 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  46.03 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  42.46 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  44.95 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  46.34 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  45.45 
 
 		 384 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  42.78 
 
 		 377 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  43.62 
 
 		 381 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  44.56 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  43.57 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.18 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  41.6 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.25 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  42.25 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.42 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  41.69 
 
 		 381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  42.33 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  42.33 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  41.98 
 
 		 383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  42.33 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  42.33 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  41.8 
 
 		 379 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  42.06 
 
 		 379 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  42.13 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  42.42 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  42.42 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  42.42 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  42.42 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.16 
 
 		 380 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  42.42 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  40.98 
 
 		 383 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  42.13 
 
 		 380 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  41.47 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.67 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  39.95 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  39.95 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  42.82 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  43.35 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  39.95 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  42.48 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  40.83 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  41.16 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  43.43 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  41.21 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  41.42 
 
 		 379 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  40.96 
 
 		 380 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  40.1 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  40.87 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  40.96 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  40.63 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  39.47 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  39.63 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  39.63 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  40.15 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  39.95 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  41.62 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  43.58 
 
 		 377 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.52 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  40.57 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  41.73 
 
 		 383 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>