More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1250 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 376 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  61.67 
 
 		 380 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  61.67 
 
 		 380 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  59.57 
 
 		 381 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  59.45 
 
 		 379 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  60.11 
 
 		 381 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  58.98 
 
 		 383 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  58.76 
 
 		 381 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  59.89 
 
 		 383 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  58.49 
 
 		 381 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  58.98 
 
 		 374 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  57.97 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  57.03 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  57.03 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  56.76 
 
 		 379 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  57.03 
 
 		 379 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  57.3 
 
 		 379 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  56.76 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  52.33 
 
 		 383 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  51.81 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  52.27 
 
 		 375 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  53.6 
 
 		 384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  51.2 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50.93 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  51.2 
 
 		 375 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  51.56 
 
 		 384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  49.22 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  49.22 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.7 
 
 		 391 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  50.41 
 
 		 375 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  48.09 
 
 		 383 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  49.49 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  50.13 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  50.13 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  50.13 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  50.13 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  50.13 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  50.13 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  50.13 
 
 		 384 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  49.6 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  47.29 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  47.73 
 
 		 386 aa  316  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  48.33 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  48 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  48.66 
 
 		 384 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  49.74 
 
 		 383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  48.13 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  48.13 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  48.13 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  47.56 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  47.56 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  47.56 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  47.56 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  47.56 
 
 		 384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  47.3 
 
 		 384 aa  308  9e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  48 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  48.79 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  47.47 
 
 		 386 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  48.53 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  49.33 
 
 		 409 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  49.06 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  48.53 
 
 		 377 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  46.45 
 
 		 383 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  43.32 
 
 		 380 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47.76 
 
 		 381 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48 
 
 		 377 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  43.78 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  44.59 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  44.85 
 
 		 380 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.92 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  44.85 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  44.59 
 
 		 379 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1124  OmpC family outer membrane porin  44.59 
 
 		 395 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  44.65 
 
 		 389 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  44.65 
 
 		 389 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  44.65 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  42.16 
 
 		 380 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  43.52 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.07 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  44.94 
 
 		 383 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  43.01 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  43.33 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  44.72 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.86 
 
 		 383 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  47.62 
 
 		 374 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  47.62 
 
 		 374 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  44.17 
 
 		 386 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  43.67 
 
 		 384 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  47.34 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  44.41 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  47.62 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.22 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  44.26 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  47.28 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  47.37 
 
 		 376 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  47.37 
 
 		 376 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  47.37 
 
 		 376 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  44.71 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  47.37 
 
 		 376 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  43.37 
 
 		 471 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>