More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1234 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  88.02 
 
 
384 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  88.02 
 
 
384 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  88.02 
 
 
384 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  94.01 
 
 
384 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
384 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  95.05 
 
 
384 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  87.24 
 
 
414 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  88.02 
 
 
384 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  88.02 
 
 
384 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  88.02 
 
 
384 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  90.89 
 
 
384 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  94.01 
 
 
384 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  95.05 
 
 
384 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  95.05 
 
 
384 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  88.02 
 
 
384 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  68.48 
 
 
383 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  66.94 
 
 
386 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  65.12 
 
 
385 aa  484  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  62.5 
 
 
383 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  62.34 
 
 
381 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  62.06 
 
 
394 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  65.19 
 
 
386 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  61.25 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  62.06 
 
 
394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  60.72 
 
 
383 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  58.55 
 
 
382 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  50.65 
 
 
383 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  52.59 
 
 
381 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.66 
 
 
383 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.41 
 
 
383 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.54 
 
 
379 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.54 
 
 
379 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.54 
 
 
379 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  54.22 
 
 
380 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.79 
 
 
379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.28 
 
 
379 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.94 
 
 
380 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  53.32 
 
 
379 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  50.13 
 
 
377 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.79 
 
 
379 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  52.88 
 
 
374 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  52.44 
 
 
383 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  51.5 
 
 
382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52.03 
 
 
381 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  51.16 
 
 
383 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  49.49 
 
 
386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  49.75 
 
 
381 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  49.73 
 
 
379 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.87 
 
 
381 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 
381 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  50.51 
 
 
384 aa  335  7e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  48.38 
 
 
384 aa  332  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  50.13 
 
 
377 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  48.38 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  48.38 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  48.38 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  48.38 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  48.38 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
377 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  48.13 
 
 
384 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  47.89 
 
 
380 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  47.34 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  47.38 
 
 
384 aa  326  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.49 
 
 
384 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  47.4 
 
 
389 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  47.4 
 
 
389 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  47.14 
 
 
389 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  47.18 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  47.18 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  46.62 
 
 
391 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.37 
 
 
409 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  46.37 
 
 
409 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  48.8 
 
 
376 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  48.28 
 
 
436 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  48.28 
 
 
386 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  48.28 
 
 
386 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  47.5 
 
 
380 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  48.28 
 
 
386 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  48.28 
 
 
386 aa  316  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  48.28 
 
 
386 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  48 
 
 
380 aa  315  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  50.5 
 
 
383 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  50.5 
 
 
383 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  47 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  48.27 
 
 
436 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  48.03 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  47.26 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  49.25 
 
 
385 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  50 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  49 
 
 
385 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  47.65 
 
 
389 aa  309  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  46.75 
 
 
380 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  46.75 
 
 
380 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  50.62 
 
 
389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  46.77 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  47.03 
 
 
375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  50.86 
 
 
389 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.33 
 
 
363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  47.37 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  46.1 
 
 
383 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>