More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2400 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  90.03 
 
 		 391 aa  688    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 390 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  74.36 
 
 		 383 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  77.44 
 
 		 409 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  76.41 
 
 		 383 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  71.79 
 
 		 384 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  71.79 
 
 		 384 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  71.54 
 
 		 384 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  71.54 
 
 		 384 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  71.54 
 
 		 384 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  71.54 
 
 		 384 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  71.03 
 
 		 384 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  67.87 
 
 		 383 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  64.69 
 
 		 380 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  64.42 
 
 		 380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  60.51 
 
 		 380 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  60.77 
 
 		 380 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  60.51 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  60.51 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  60.51 
 
 		 379 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  61.19 
 
 		 411 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  54.39 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  54.14 
 
 		 379 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  54.39 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  53.88 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  54.39 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  54.39 
 
 		 379 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  53.88 
 
 		 379 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  55 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  55 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  54.02 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  55.47 
 
 		 374 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  52.74 
 
 		 383 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  52 
 
 		 383 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  52.88 
 
 		 381 aa  355  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  53.97 
 
 		 380 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  53.74 
 
 		 380 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  51.74 
 
 		 384 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.25 
 
 		 381 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  53.6 
 
 		 384 aa  342  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  51.12 
 
 		 381 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  49 
 
 		 379 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.25 
 
 		 391 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  48.25 
 
 		 409 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  48.25 
 
 		 409 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  48 
 
 		 376 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  48.86 
 
 		 375 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  50.63 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  48.61 
 
 		 375 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47.39 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47.39 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47.39 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47.39 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47.39 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47.39 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47.39 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  47.59 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  47.59 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.49 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.7 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  46.15 
 
 		 414 aa  306  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.12 
 
 		 377 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  48.4 
 
 		 392 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47.59 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  47.12 
 
 		 384 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.7 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.7 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.7 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  47.76 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  46.86 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  50.26 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  48.01 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  48.51 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  48.51 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  46.34 
 
 		 387 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  48.26 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  48.26 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  48.26 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  48.26 
 
 		 376 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.15 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  48.26 
 
 		 374 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.88 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.61 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  46.93 
 
 		 375 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.03 
 
 		 385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.78 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  48.16 
 
 		 362 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  48.16 
 
 		 362 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  48.16 
 
 		 362 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.98 
 
 		 385 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  47.93 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.67 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.67 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  46.25 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.42 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  44.62 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  50.4 
 
 		 361 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  45.39 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.28 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  46.34 
 
 		 385 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>