More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3938 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3938  porin  100 
 
 
363 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  80.38 
 
 
372 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  80.38 
 
 
372 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  79.35 
 
 
362 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  79.35 
 
 
362 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  79.35 
 
 
362 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  76.86 
 
 
374 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  73.87 
 
 
374 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  79.08 
 
 
361 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  74.13 
 
 
374 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  73.87 
 
 
374 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  73.87 
 
 
374 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  73.47 
 
 
376 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  73.47 
 
 
376 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  73.47 
 
 
376 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  73.47 
 
 
376 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  65.54 
 
 
377 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  65.27 
 
 
377 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  58.47 
 
 
372 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52.16 
 
 
381 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  51.14 
 
 
387 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51.41 
 
 
381 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  49.74 
 
 
384 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.66 
 
 
384 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  53.32 
 
 
380 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  50.9 
 
 
383 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  50.26 
 
 
414 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  51.53 
 
 
383 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  50.52 
 
 
379 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  50.52 
 
 
379 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  50.52 
 
 
379 aa  322  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  50.52 
 
 
379 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  52.81 
 
 
380 aa  322  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  51.28 
 
 
383 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  50.26 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  50.9 
 
 
383 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  48.34 
 
 
383 aa  318  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  49.48 
 
 
379 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  50.26 
 
 
379 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  49.74 
 
 
380 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.62 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  48.97 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.38 
 
 
381 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  51.19 
 
 
374 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  48.59 
 
 
384 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  48.85 
 
 
380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  48.33 
 
 
384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  51.36 
 
 
383 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  48.07 
 
 
384 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  48.07 
 
 
384 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  48.07 
 
 
384 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  47.81 
 
 
384 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  47.81 
 
 
384 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  47.81 
 
 
384 aa  301  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  47.3 
 
 
384 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  47.3 
 
 
384 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  49.36 
 
 
380 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  47.3 
 
 
384 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  50.96 
 
 
409 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  48.85 
 
 
380 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  47.81 
 
 
384 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  49.1 
 
 
380 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  48.7 
 
 
383 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  46.92 
 
 
381 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  48.59 
 
 
379 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  47.74 
 
 
391 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  47.56 
 
 
384 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  47.36 
 
 
390 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  48.17 
 
 
376 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  48.33 
 
 
384 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  49.1 
 
 
379 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  47.38 
 
 
375 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  47.38 
 
 
375 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  47.71 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  44.96 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  46.11 
 
 
411 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  46.22 
 
 
386 aa  278  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  46.6 
 
 
375 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  46.6 
 
 
375 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  43.95 
 
 
396 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  46.19 
 
 
409 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.19 
 
 
409 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  46.08 
 
 
391 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  45.43 
 
 
392 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  46.06 
 
 
383 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  46.06 
 
 
383 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.59 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.93 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  46.13 
 
 
384 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  45.32 
 
 
383 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  45.9 
 
 
386 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.29 
 
 
383 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  45.38 
 
 
386 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>