More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1374 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  86.2 
 
 		 384 aa  653    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  88.02 
 
 		 384 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  97.66 
 
 		 414 aa  742    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  85.16 
 
 		 384 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  86.2 
 
 		 384 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  86.2 
 
 		 384 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  100 
 
 		 384 aa  769    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  85.16 
 
 		 384 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  84.64 
 
 		 384 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  66.67 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  65.1 
 
 		 383 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  63.64 
 
 		 381 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  65.3 
 
 		 386 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  63.59 
 
 		 385 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  63.28 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  60.81 
 
 		 396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  64.64 
 
 		 386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  61.56 
 
 		 394 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  60.72 
 
 		 383 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  60.1 
 
 		 382 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  51.69 
 
 		 383 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  53.63 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.94 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.91 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.94 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  53.2 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.94 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  52.66 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.69 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.39 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  49.48 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  52.94 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  52.64 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  52.65 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.4 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52.81 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  51.54 
 
 		 379 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  51.41 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  49.11 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  50.82 
 
 		 382 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  50.64 
 
 		 381 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  50.64 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  51.13 
 
 		 381 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  52.39 
 
 		 381 aa  348  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.66 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  50.75 
 
 		 377 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  49.75 
 
 		 380 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  50.63 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  49.12 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  49.12 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  49.12 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  48.5 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  49.12 
 
 		 384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  49.12 
 
 		 384 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  49.12 
 
 		 384 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  48.87 
 
 		 384 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  48.87 
 
 		 409 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  48.87 
 
 		 409 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  50.26 
 
 		 384 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  48.59 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  48.59 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  48.56 
 
 		 384 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.62 
 
 		 391 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  49.13 
 
 		 436 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  49.13 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  49.13 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  49.13 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  49.13 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  49.13 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  48.33 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  50 
 
 		 383 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  50 
 
 		 383 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  48.88 
 
 		 386 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  48.23 
 
 		 391 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  48.25 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  47.5 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  48.39 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  47.63 
 
 		 380 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  49.35 
 
 		 375 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  49.88 
 
 		 385 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  48 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  49.63 
 
 		 385 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  46.92 
 
 		 382 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  46.92 
 
 		 382 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  48 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  50.26 
 
 		 363 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  50.13 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.16 
 
 		 389 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  49.26 
 
 		 383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  48 
 
 		 379 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  50.61 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  48.61 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  47.39 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  47.8 
 
 		 375 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>