More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0615 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  100 
 
 
376 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
376 aa  745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  99.2 
 
 
374 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  98.94 
 
 
374 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  100 
 
 
376 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  99.2 
 
 
374 aa  705    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  100 
 
 
376 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  99.47 
 
 
374 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  78.36 
 
 
374 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  77.17 
 
 
362 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  77.17 
 
 
362 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  77.17 
 
 
362 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  76.32 
 
 
361 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  73.47 
 
 
363 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  75.13 
 
 
372 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  75.13 
 
 
372 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  64.62 
 
 
377 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  63.33 
 
 
377 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  57.7 
 
 
372 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  51.5 
 
 
387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  52 
 
 
381 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  50.51 
 
 
383 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  50.25 
 
 
383 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  50.75 
 
 
381 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  50.5 
 
 
384 aa  322  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  49.87 
 
 
379 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  49.62 
 
 
379 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  49.62 
 
 
379 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  49.62 
 
 
379 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  49.37 
 
 
379 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  49.37 
 
 
379 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  51.63 
 
 
384 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  49.61 
 
 
374 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  51.01 
 
 
381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  49.49 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  48.97 
 
 
383 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  51.65 
 
 
380 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  51.65 
 
 
380 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  48.87 
 
 
383 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  48.26 
 
 
390 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47.73 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47.73 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47.73 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47.73 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47.73 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47.73 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  49.11 
 
 
379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47.73 
 
 
384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  46.12 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  48.21 
 
 
380 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  46.72 
 
 
414 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  48.12 
 
 
383 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  49.33 
 
 
383 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  46.4 
 
 
391 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  46.46 
 
 
384 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  47.09 
 
 
392 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  46.08 
 
 
381 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  48.92 
 
 
409 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.96 
 
 
384 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.96 
 
 
384 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.96 
 
 
384 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  46.84 
 
 
384 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  45.96 
 
 
384 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  46.68 
 
 
380 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  46.68 
 
 
380 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  46.84 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  46.84 
 
 
384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  47.18 
 
 
380 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  45.69 
 
 
383 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  46.58 
 
 
384 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  46.58 
 
 
384 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  46.58 
 
 
384 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  46.92 
 
 
380 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  46.58 
 
 
384 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.45 
 
 
384 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  46.72 
 
 
379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  46.68 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  44.03 
 
 
386 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.03 
 
 
385 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  46.21 
 
 
384 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  46.68 
 
 
379 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  47.37 
 
 
376 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  46.4 
 
 
411 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  45.73 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  43.32 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  42.39 
 
 
383 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  46.21 
 
 
383 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  45.11 
 
 
409 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  44.92 
 
 
386 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  45.11 
 
 
409 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  46.21 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  43.1 
 
 
396 aa  272  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  45 
 
 
391 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  45.73 
 
 
386 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  46.15 
 
 
375 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.07 
 
 
394 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  45.9 
 
 
375 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  44.89 
 
 
389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.72 
 
 
383 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.72 
 
 
383 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>