More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1228 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 387 aa  777    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  52.67 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  52.67 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  52.67 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  52.28 
 
 		 374 aa  342  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  51.79 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  52.36 
 
 		 372 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  51.5 
 
 		 374 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  51.5 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  51.25 
 
 		 374 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  51.89 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  51.5 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  51.5 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  51.5 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  51.25 
 
 		 374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  51.64 
 
 		 372 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  52.91 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  51 
 
 		 374 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  52.66 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  48.29 
 
 		 381 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  51.14 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  47.2 
 
 		 381 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  46.47 
 
 		 383 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  46.23 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  46.59 
 
 		 379 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  46.34 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  46.34 
 
 		 379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  46.34 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  46.34 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  47.19 
 
 		 392 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  48.9 
 
 		 380 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  48.9 
 
 		 380 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  48.01 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  48.91 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.31 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  46.02 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  44.88 
 
 		 379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  45.97 
 
 		 381 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  46.1 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  46.67 
 
 		 383 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  47.33 
 
 		 379 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  46.53 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  49 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  49 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  47.01 
 
 		 380 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  46.12 
 
 		 383 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  42.86 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  49.47 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  49.87 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  46.34 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  47.92 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  47.01 
 
 		 380 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  45.77 
 
 		 380 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  46.21 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  47.01 
 
 		 379 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  43.21 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  43.21 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  43.21 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  43.21 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  43.21 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  43.21 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  43.21 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  45.99 
 
 		 391 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  43.7 
 
 		 414 aa  291  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  46.21 
 
 		 383 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  45.26 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  45.26 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  43.35 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  43.35 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  43.6 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  43.35 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.31 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.31 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  45.01 
 
 		 391 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.31 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  43.67 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  43.84 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  44.78 
 
 		 375 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  43.46 
 
 		 384 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  42.68 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  44.53 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  43.35 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  44.53 
 
 		 375 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  44.53 
 
 		 375 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  42.75 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.73 
 
 		 385 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  42.75 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  42.75 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  42.75 
 
 		 436 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  42.75 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  42.75 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.49 
 
 		 385 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  42.75 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  43.87 
 
 		 384 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  43.87 
 
 		 384 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.38 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  43.63 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  43.63 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  43.63 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  42.51 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>