More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3798 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  97.87 
 
 
375 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  100 
 
 
375 aa  752    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  93.6 
 
 
375 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  97.87 
 
 
375 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  77.45 
 
 
375 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  58.75 
 
 
383 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  58.75 
 
 
383 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  58.07 
 
 
384 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  56.33 
 
 
384 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  50.64 
 
 
386 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  49.62 
 
 
386 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  49.87 
 
 
386 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  50.93 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  53.12 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51.14 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.24 
 
 
381 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  52.03 
 
 
383 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  51.78 
 
 
383 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  50 
 
 
380 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  48.97 
 
 
380 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.54 
 
 
381 aa  330  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.54 
 
 
379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.54 
 
 
379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.54 
 
 
379 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  49.74 
 
 
381 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.54 
 
 
379 aa  329  6e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  51.95 
 
 
374 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  51.61 
 
 
379 aa  328  7e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.28 
 
 
379 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  51.15 
 
 
380 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  51.28 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  50.9 
 
 
380 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  49.62 
 
 
391 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  48.97 
 
 
380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  49.08 
 
 
377 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  48.71 
 
 
380 aa  326  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  49.36 
 
 
409 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  49.36 
 
 
409 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  49.6 
 
 
380 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  49.6 
 
 
380 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  49.1 
 
 
379 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  49.48 
 
 
383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  50.38 
 
 
383 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  48.44 
 
 
377 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  48.7 
 
 
377 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  48.86 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  47 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  47.8 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  47.8 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  47.8 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  47.8 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  47.8 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  47.8 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  47.8 
 
 
384 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  45.85 
 
 
383 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  50.94 
 
 
384 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  47.29 
 
 
414 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  51.21 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  48.25 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  50.13 
 
 
384 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  50.13 
 
 
384 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  47.79 
 
 
383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  46.75 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  44.81 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  45.5 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  46.77 
 
 
384 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  49.87 
 
 
384 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  45.08 
 
 
403 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.25 
 
 
384 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.99 
 
 
384 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.99 
 
 
384 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  47.31 
 
 
391 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.99 
 
 
384 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  46.58 
 
 
385 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  45.74 
 
 
384 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  44.68 
 
 
407 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  44.68 
 
 
407 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  44.19 
 
 
403 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  46.74 
 
 
380 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  44.19 
 
 
403 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  47.67 
 
 
386 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  43.48 
 
 
419 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  44.19 
 
 
398 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  46.34 
 
 
382 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  46.34 
 
 
382 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  50 
 
 
409 aa  292  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  44.41 
 
 
407 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.5 
 
 
385 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  44.41 
 
 
407 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.9 
 
 
383 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  44.41 
 
 
407 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  44.41 
 
 
407 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  44.41 
 
 
419 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  44.5 
 
 
385 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  47.67 
 
 
394 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.61 
 
 
389 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  44.07 
 
 
471 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>